More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4139 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 390 aa  778    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  56.88 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  49.61 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  50.13 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  47.31 
 
 		 392 aa  355  8.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  46.25 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  45.1 
 
 		 390 aa  342  5.999999999999999e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  49.1 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  49.36 
 
 		 398 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  49.1 
 
 		 398 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  48.57 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  48.72 
 
 		 397 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  45.18 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  44.92 
 
 		 387 aa  322  9.000000000000001e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  46.51 
 
 		 399 aa  319  7e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  45.55 
 
 		 379 aa  318  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  49.35 
 
 		 388 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  49.09 
 
 		 399 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  47.68 
 
 		 397 aa  312  7.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  45.83 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  49.35 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  46.09 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  43.12 
 
 		 379 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  44.62 
 
 		 383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  45.22 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  44.3 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  46.25 
 
 		 391 aa  310  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  45.24 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  43.64 
 
 		 400 aa  309  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  45.83 
 
 		 397 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  43.36 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  42.53 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  45.57 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  45.57 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  43.33 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  47.85 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  44.78 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  44.79 
 
 		 381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  47.34 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  46.09 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0970  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.04 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111967  normal  0.585496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  41.24 
 
 		 413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  45.22 
 
 		 397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  47.15 
 
 		 391 aa  302  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  45.31 
 
 		 397 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  45.69 
 
 		 394 aa  303  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  43.07 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  45.1 
 
 		 394 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.81 
 
 		 427 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  44.04 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  41.58 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  41.58 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  45.48 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  48.34 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  45.48 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  41.33 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1420  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.87 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.164572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2691  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.87 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118315  normal  0.592625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  41.33 
 
 		 391 aa  299  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  41.58 
 
 		 391 aa  299  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2040  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.67 
 
 		 428 aa  299  6e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  40.56 
 
 		 392 aa  298  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  43.44 
 
 		 393 aa  298  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  41.33 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  47.04 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  47.51 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  45.24 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  43.48 
 
 		 379 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  41.07 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  41.07 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  41.07 
 
 		 392 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2286  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.33 
 
 		 426 aa  296  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  45.06 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1588  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.33 
 
 		 426 aa  296  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  47.24 
 
 		 390 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  46.53 
 
 		 426 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  47.79 
 
 		 394 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  46.98 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  45.94 
 
 		 426 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2814  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.86 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6240  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  43.36 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  39.43 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  46.65 
 
 		 392 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.41 
 
 		 378 aa  292  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1758  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.19 
 
 		 428 aa  292  7e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00831826  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2667  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.62 
 
 		 426 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338224  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  43.4 
 
 		 401 aa  292  9e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3102  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  41.11 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  46.27 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1719  cystathionine gamma-synthase  42 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4832  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.18 
 
 		 449 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3089  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.84 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  43.59 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.83 
 
 		 397 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  43.37 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3960  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  42.24 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.993193 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1994  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.62 
 
 		 467 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  42.2 
 
 		 401 aa  289  6e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>