More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0798 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  100 
 
 
396 aa  810    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  67.62 
 
 
398 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  67.44 
 
 
399 aa  541  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  67.1 
 
 
398 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  67.36 
 
 
398 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  66.75 
 
 
397 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  63.57 
 
 
400 aa  518  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  63.5 
 
 
418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  60.36 
 
 
399 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  56.67 
 
 
393 aa  461  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  60.1 
 
 
394 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  52.58 
 
 
401 aa  444  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  47.58 
 
 
394 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  49.23 
 
 
392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  50 
 
 
392 aa  388  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 
392 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  49.22 
 
 
391 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  50 
 
 
392 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 
392 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 
391 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 
392 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  50 
 
 
391 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  47.29 
 
 
390 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  50 
 
 
391 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 
392 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 
397 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  48.96 
 
 
397 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  50.91 
 
 
397 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  49.22 
 
 
397 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  50.77 
 
 
391 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  48.84 
 
 
392 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  49.61 
 
 
397 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  50.13 
 
 
397 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 
397 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  48.45 
 
 
397 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  46.67 
 
 
399 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  50.39 
 
 
390 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  48.7 
 
 
397 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  46.79 
 
 
396 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  47.27 
 
 
413 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  48.21 
 
 
392 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  47.55 
 
 
394 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  48.33 
 
 
393 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  48.19 
 
 
392 aa  354  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  48.2 
 
 
394 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  50.63 
 
 
401 aa  352  8e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  44.1 
 
 
392 aa  349  5e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  48.34 
 
 
400 aa  345  8.999999999999999e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  47.09 
 
 
407 aa  341  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.9 
 
 
427 aa  338  7e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  48.57 
 
 
390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.35 
 
 
392 aa  334  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.59 
 
 
397 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  44.56 
 
 
379 aa  332  6e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  47.55 
 
 
394 aa  332  7.000000000000001e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  44.56 
 
 
386 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  44.82 
 
 
386 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  46.91 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  43.67 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  46.91 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  43.67 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.73 
 
 
403 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  44.56 
 
 
386 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  45.74 
 
 
390 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  44.04 
 
 
383 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.42 
 
 
397 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  47.55 
 
 
389 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  45.99 
 
 
383 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  45.61 
 
 
398 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  45.08 
 
 
384 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  45.22 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  45.22 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  44.44 
 
 
378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  44.64 
 
 
380 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.27 
 
 
396 aa  319  6e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  45.76 
 
 
397 aa  318  9e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  45.34 
 
 
388 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  45.38 
 
 
392 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  45.97 
 
 
377 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.48 
 
 
403 aa  315  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  45.6 
 
 
381 aa  316  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  44.16 
 
 
386 aa  315  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  44.53 
 
 
386 aa  315  7e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  45.22 
 
 
380 aa  315  9e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  42.71 
 
 
387 aa  314  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6240  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  42.76 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  43.49 
 
 
378 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2040  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.9 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  45.9 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.19 
 
 
387 aa  311  9e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.47 
 
 
403 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.96 
 
 
403 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  44.36 
 
 
394 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  44.62 
 
 
394 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  45.1 
 
 
383 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  44.87 
 
 
391 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1758  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.43 
 
 
428 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00831826  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.6 
 
 
395 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1309  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.94 
 
 
428 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0637456  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1690  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.86 
 
 
427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>