More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2677 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
394 aa  818    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  80.67 
 
 
392 aa  667    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  73.06 
 
 
390 aa  617  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  53.87 
 
 
401 aa  443  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  55.06 
 
 
399 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  53.61 
 
 
393 aa  436  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  51.66 
 
 
413 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  51.8 
 
 
392 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  51.44 
 
 
399 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  50.78 
 
 
400 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  51.8 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  51.03 
 
 
397 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  51.04 
 
 
397 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  50.78 
 
 
397 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  47.58 
 
 
396 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  50.78 
 
 
397 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  50.52 
 
 
397 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  51.93 
 
 
394 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  48.6 
 
 
399 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  50.52 
 
 
397 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  52.58 
 
 
392 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  50.52 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  50.52 
 
 
397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  50.52 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  51.93 
 
 
393 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  51.03 
 
 
390 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  53.09 
 
 
392 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  47.03 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  47.29 
 
 
398 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  47.03 
 
 
398 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  47.53 
 
 
397 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  47.42 
 
 
391 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  47.16 
 
 
392 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  48.82 
 
 
394 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  47.16 
 
 
392 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  46.91 
 
 
392 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  47.16 
 
 
391 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  46.91 
 
 
392 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  47.16 
 
 
391 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  46.91 
 
 
391 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  47.31 
 
 
392 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  47.56 
 
 
392 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  47.03 
 
 
418 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  47.94 
 
 
398 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  46.65 
 
 
396 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.45 
 
 
402 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  48.09 
 
 
391 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  45.92 
 
 
397 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  46.56 
 
 
401 aa  375  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  46.55 
 
 
390 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  48.07 
 
 
383 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  46.29 
 
 
390 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  46.37 
 
 
401 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  46.04 
 
 
390 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  44.44 
 
 
392 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  45 
 
 
398 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  47.3 
 
 
387 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  46.95 
 
 
400 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  46.91 
 
 
393 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  48.45 
 
 
378 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  45.76 
 
 
388 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  46.58 
 
 
407 aa  364  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  47.04 
 
 
387 aa  364  2e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  46.61 
 
 
394 aa  361  1e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  44 
 
 
434 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  43.75 
 
 
390 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  45.13 
 
 
386 aa  357  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  44.53 
 
 
378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  46.51 
 
 
397 aa  355  6.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  45.48 
 
 
382 aa  354  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  47.04 
 
 
383 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  44.64 
 
 
386 aa  354  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  43.9 
 
 
386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  43.9 
 
 
386 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  46.25 
 
 
390 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  43.95 
 
 
383 aa  349  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  44.33 
 
 
381 aa  348  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  43.38 
 
 
386 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.78 
 
 
393 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  44.5 
 
 
392 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  49.32 
 
 
377 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  45.31 
 
 
385 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  44.07 
 
 
379 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2823  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  41.98 
 
 
443 aa  346  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561199  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.93 
 
 
397 aa  346  4e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  43.11 
 
 
390 aa  346  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  43.19 
 
 
392 aa  346  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  45.6 
 
 
378 aa  345  7e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  45.6 
 
 
377 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.37 
 
 
393 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  43.12 
 
 
386 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.96 
 
 
404 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.96 
 
 
404 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.01 
 
 
406 aa  342  8e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  44.65 
 
 
386 aa  342  9e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.14 
 
 
383 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  44.33 
 
 
380 aa  340  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  45.08 
 
 
377 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  45.08 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>