More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2200 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 401 aa  830    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  74.81 
 
 		 393 aa  618  1e-176  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  55.95 
 
 		 398 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  55.7 
 
 		 398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  55.19 
 
 		 398 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  55.16 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  55.03 
 
 		 397 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  55.38 
 
 		 399 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  54.76 
 
 		 392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  54.12 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  54.73 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  53.87 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  54.29 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  54.64 
 
 		 390 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  52.58 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  55.67 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  52 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  51.8 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  52.58 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  51.8 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  51.55 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  51.55 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  52.31 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  51.01 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  51.91 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  51.8 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  51.8 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  51.55 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  52.44 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  51.28 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  52.31 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  49.49 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  50.13 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  48.97 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  47.79 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  46.48 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  44.81 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  46.7 
 
 		 400 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  45.39 
 
 		 391 aa  362  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  45.14 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  45.14 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  44.89 
 
 		 392 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  45.14 
 
 		 391 aa  359  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  44.89 
 
 		 392 aa  359  6e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  44.64 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  45.14 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  44.64 
 
 		 391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  44.64 
 
 		 391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  45.57 
 
 		 393 aa  352  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.14 
 
 		 397 aa  352  8.999999999999999e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  44.78 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.8 
 
 		 394 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  46.04 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  45.16 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  42.05 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.41 
 
 		 393 aa  345  6e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.3 
 
 		 392 aa  345  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  46.95 
 
 		 401 aa  345  8.999999999999999e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.38 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.79 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.38 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1309  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.76 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0637456  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.39 
 
 		 395 aa  341  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  43.13 
 
 		 434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.38 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.19 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  44.82 
 
 		 378 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.19 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1146  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.94 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000163408  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.29 
 
 		 396 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.94 
 
 		 396 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.69 
 
 		 396 aa  332  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.64 
 
 		 410 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.48 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  46.29 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.25 
 
 		 403 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1124  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.45 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000369055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.42 
 
 		 399 aa  331  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1719  cystathionine gamma-synthase  41.77 
 
 		 429 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2823  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  41.55 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561199  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.39 
 
 		 410 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43 
 
 		 393 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 		 391 aa  329  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4875  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  43.41 
 
 		 446 aa  329  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0839927  normal  0.10563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  41.39 
 
 		 381 aa  329  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3131  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.45 
 
 		 441 aa  329  6e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.89 
 
 		 386 aa  329  7e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13730  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  42.08 
 
 		 432 aa  328  7e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125718  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.11 
 
 		 396 aa  328  8e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  41.07 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3858  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.69 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0610  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.49 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1842  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.95 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000076838  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.93 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1317  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  44.03 
 
 		 438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3718  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.86 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3960  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.86 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.993193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  41.79 
 
 		 390 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.78 
 
 		 396 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1225  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  41.98 
 
 		 435 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.633998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>