More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1559 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  82.65 
 
 		 392 aa  686    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 392 aa  801    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  76.79 
 
 		 393 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  72.22 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  71.97 
 
 		 397 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  72.22 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  71.72 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  71.21 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  71.83 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  71.46 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  71.46 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  70.96 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  71.54 
 
 		 390 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  72.19 
 
 		 392 aa  578  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  73.01 
 
 		 391 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  71.39 
 
 		 394 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  60.78 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  53.09 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  52.67 
 
 		 392 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  52.86 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  50.39 
 
 		 393 aa  411  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  50.13 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  49.22 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  49.22 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  50 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  48.7 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  49.22 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  48.32 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 		 391 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 		 391 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  49.22 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  48.19 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  48.32 
 
 		 400 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  48.3 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  46.61 
 
 		 399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  43.73 
 
 		 392 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  45.74 
 
 		 418 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  44.3 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  47.59 
 
 		 407 aa  348  7e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  47.4 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.56 
 
 		 397 aa  345  8.999999999999999e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  45.88 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  45.66 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  47.27 
 
 		 400 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  46.7 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.78 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.78 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.93 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  45.43 
 
 		 391 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.26 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  43.86 
 
 		 386 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  44.13 
 
 		 386 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  44.13 
 
 		 386 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  44.5 
 
 		 386 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1086  cystathionine gamma-synthase  41.49 
 
 		 401 aa  330  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0544  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.8 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  41.13 
 
 		 414 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.34 
 
 		 396 aa  329  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  41.49 
 
 		 402 aa  328  7e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  46.35 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  45.31 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.01 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  45.29 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.05 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  43.81 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.05 
 
 		 394 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  45.6 
 
 		 378 aa  325  9e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.01 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.8 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.23 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.73 
 
 		 393 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.19 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  40.31 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  43.78 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  42.42 
 
 		 388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  43.78 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.41 
 
 		 397 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  43.78 
 
 		 377 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.42 
 
 		 397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  44.04 
 
 		 377 aa  319  6e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  44.04 
 
 		 377 aa  319  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  44.19 
 
 		 386 aa  319  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  44.04 
 
 		 377 aa  319  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.31 
 
 		 403 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  44.04 
 
 		 377 aa  318  9e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  44.04 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  44.07 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  44.04 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  44.04 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  43.52 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.41 
 
 		 394 aa  316  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  43.78 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.37 
 
 		 402 aa  316  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  41.87 
 
 		 390 aa  316  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>