More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0729 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  94.53 
 
 		 386 aa  740    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  95.05 
 
 		 386 aa  746    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 386 aa  784    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  94.79 
 
 		 386 aa  743    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  50.52 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  50.13 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  44.68 
 
 		 390 aa  352  7e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  44.3 
 
 		 392 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  43.12 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  45.22 
 
 		 399 aa  335  5.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  46.74 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  46.88 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  46.47 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  45.03 
 
 		 397 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  46.2 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  42.6 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  45.19 
 
 		 398 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  44.94 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  44.68 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  44.68 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  46.74 
 
 		 390 aa  322  7e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  43.52 
 
 		 392 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  45.65 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  45.38 
 
 		 397 aa  319  6e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  46.2 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  45.38 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  43.52 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  45.11 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  44.16 
 
 		 396 aa  315  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  44.5 
 
 		 392 aa  315  8e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  44.84 
 
 		 397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  43.15 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  43.15 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  43.15 
 
 		 392 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  42.89 
 
 		 392 aa  308  8e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  42.64 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  43.52 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  42.89 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  42.38 
 
 		 392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  42.67 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  42.67 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  42.64 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  43.01 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  41.13 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  42.64 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  40.67 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  42.82 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  43.51 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  42.64 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  42.97 
 
 		 380 aa  296  6e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  40.21 
 
 		 394 aa  291  9e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  43.38 
 
 		 394 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  41.9 
 
 		 377 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  41.9 
 
 		 377 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  42.23 
 
 		 378 aa  286  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  40.67 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  40.72 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  41.97 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  41.65 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  41.65 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  41.65 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  42.38 
 
 		 379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  41.39 
 
 		 377 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  41.34 
 
 		 383 aa  282  7.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  40.72 
 
 		 398 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  42.89 
 
 		 394 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  41.39 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  41.39 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  42.49 
 
 		 378 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  41.39 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.18 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  41.39 
 
 		 377 aa  280  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  40.93 
 
 		 383 aa  279  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  41.13 
 
 		 381 aa  278  9e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  40.31 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.98 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  42.01 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  42.27 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  41.49 
 
 		 380 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0734  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.45 
 
 		 429 aa  276  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.12755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.42 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1906  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.33 
 
 		 423 aa  276  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  40.57 
 
 		 378 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  40.87 
 
 		 380 aa  275  7e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  38.34 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  41.9 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1330  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.76 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000859457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  40.84 
 
 		 423 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  40.84 
 
 		 423 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  41.6 
 
 		 378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  37.31 
 
 		 392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  39.43 
 
 		 379 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2851  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.14 
 
 		 423 aa  272  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  39.64 
 
 		 384 aa  272  9e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  42.16 
 
 		 426 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  40.52 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2823  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38.95 
 
 		 443 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  39.9 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  40.46 
 
 		 381 aa  269  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>