More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0693 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  99.53 
 
 		 423 aa  860    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  79.95 
 
 		 405 aa  643    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 423 aa  865    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  56.1 
 
 		 393 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  57.81 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  39.79 
 
 		 392 aa  295  9e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  40.58 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  40.94 
 
 		 400 aa  292  6e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  42.71 
 
 		 386 aa  292  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33390  cystathione gamma synthase  38.01 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0131523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.06 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  45.48 
 
 		 378 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 		 395 aa  288  9e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  40.1 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  40.1 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  42.12 
 
 		 377 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  44.76 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  38.18 
 
 		 392 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.25 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  40.52 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  39.4 
 
 		 399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  39.49 
 
 		 390 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 385 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  42.61 
 
 		 377 aa  282  9e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  42.61 
 
 		 377 aa  282  9e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.81 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  39.23 
 
 		 390 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  40.41 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  39.23 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  44.67 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  37.8 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.63 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.44 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  41.89 
 
 		 376 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  39.23 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  40.26 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  42.32 
 
 		 377 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.02 
 
 		 403 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  40.89 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.02 
 
 		 403 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  42.32 
 
 		 377 aa  279  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  42.32 
 
 		 377 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  40.62 
 
 		 386 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  36.18 
 
 		 393 aa  279  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.02 
 
 		 403 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  42.32 
 
 		 377 aa  279  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  39.37 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  42.03 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.73 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  40.16 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.57 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  40.26 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.98 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  39.95 
 
 		 383 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  42.03 
 
 		 377 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  39.74 
 
 		 418 aa  277  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  41.74 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.4 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  40.36 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  40.1 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  39.59 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.74 
 
 		 422 aa  276  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  39.74 
 
 		 397 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  43.92 
 
 		 378 aa  275  9e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  41.74 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.22 
 
 		 406 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.74 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  40.84 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  37.96 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  43.78 
 
 		 378 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  39.22 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  41.45 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  40.1 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  39.09 
 
 		 426 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  39.34 
 
 		 426 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.36 
 
 		 392 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  39.13 
 
 		 393 aa  272  6e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.1 
 
 		 403 aa  273  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  39.18 
 
 		 392 aa  273  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  38.46 
 
 		 376 aa  272  8.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.86 
 
 		 403 aa  272  8.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.43 
 
 		 385 aa  272  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  42.29 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  39.9 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  42.24 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  38.76 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1876  cystathionine gamma-synthase  40.06 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.562366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.67 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  40.82 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  43.82 
 
 		 394 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  40.36 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  40.35 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  38.5 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  38.78 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.89 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  40.33 
 
 		 386 aa  269  5e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  39.84 
 
 		 397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.98 
 
 		 403 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  37.37 
 
 		 394 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>