More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3143 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  96.71 
 
 
426 aa  835    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  96.71 
 
 
426 aa  835    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
426 aa  860    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  82.86 
 
 
426 aa  711    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  58.12 
 
 
386 aa  432  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  56.35 
 
 
383 aa  431  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  55.82 
 
 
378 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  52.81 
 
 
394 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  57.07 
 
 
400 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  53.06 
 
 
394 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  50.39 
 
 
382 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  57.07 
 
 
405 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  49.6 
 
 
379 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  51.97 
 
 
397 aa  378  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  50.13 
 
 
377 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  52.23 
 
 
390 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  52.22 
 
 
390 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  51.71 
 
 
390 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  51.34 
 
 
388 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  47.76 
 
 
378 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  50.91 
 
 
392 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  51.71 
 
 
390 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  47.75 
 
 
377 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.65 
 
 
387 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  47.75 
 
 
377 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 
393 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  47.07 
 
 
378 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 
393 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  49.6 
 
 
386 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.39 
 
 
387 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.39 
 
 
387 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  50.39 
 
 
386 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  47.21 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  47.63 
 
 
381 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  47.21 
 
 
377 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  47.48 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.39 
 
 
387 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  47.48 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  47.21 
 
 
377 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  52.53 
 
 
394 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  47.48 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 
394 aa  370  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  49.61 
 
 
393 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  46.95 
 
 
377 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  48.15 
 
 
381 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  46.95 
 
 
377 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  49.87 
 
 
387 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  45.31 
 
 
385 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  50 
 
 
388 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  52.24 
 
 
390 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 
386 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 
386 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  48.95 
 
 
381 aa  365  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  55.67 
 
 
405 aa  363  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  49.36 
 
 
393 aa  363  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.26 
 
 
385 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  47.09 
 
 
376 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  47.76 
 
 
387 aa  362  9e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  50.26 
 
 
381 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  47.23 
 
 
387 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.68 
 
 
402 aa  360  2e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  49.34 
 
 
378 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  47.89 
 
 
390 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  54.78 
 
 
411 aa  361  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  46.44 
 
 
377 aa  360  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.43 
 
 
389 aa  359  6e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  47.62 
 
 
401 aa  358  7e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  49.1 
 
 
386 aa  358  7e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  47.23 
 
 
394 aa  358  7e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  49.09 
 
 
388 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  49.08 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.53 
 
 
422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  48.67 
 
 
378 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  46.56 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  53.12 
 
 
385 aa  355  6.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  44.76 
 
 
380 aa  354  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  52.51 
 
 
385 aa  355  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  47.11 
 
 
377 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  46.83 
 
 
380 aa  352  8e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 
386 aa  352  8e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  44.56 
 
 
380 aa  351  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 
388 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  51.31 
 
 
388 aa  350  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  44.97 
 
 
379 aa  350  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  51.71 
 
 
390 aa  349  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  50.66 
 
 
389 aa  350  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  49.21 
 
 
425 aa  349  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  45.38 
 
 
380 aa  349  5e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  46.42 
 
 
390 aa  348  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  54.26 
 
 
390 aa  349  7e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  45.77 
 
 
398 aa  348  9e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  46.75 
 
 
393 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  46.83 
 
 
378 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  46.61 
 
 
393 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  46.35 
 
 
393 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  48.28 
 
 
381 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.19 
 
 
388 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.43 
 
 
386 aa  346  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  46.97 
 
 
392 aa  345  8e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  47.56 
 
 
391 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>