More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0615 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  100 
 
 		 390 aa  796    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  77.26 
 
 		 387 aa  624  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  77 
 
 		 387 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  76.74 
 
 		 387 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  76.49 
 
 		 387 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  77 
 
 		 389 aa  618  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  76.49 
 
 		 387 aa  615  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  77.23 
 
 		 388 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  75.71 
 
 		 393 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  75.45 
 
 		 393 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  76.04 
 
 		 386 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  74.74 
 
 		 388 aa  610  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  74.94 
 
 		 393 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  76.23 
 
 		 393 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  75.39 
 
 		 386 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  75.07 
 
 		 386 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  60.9 
 
 		 388 aa  481  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  62.83 
 
 		 400 aa  474  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2747  cystathionine gamma-synthase  59.79 
 
 		 388 aa  475  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  61.52 
 
 		 386 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  61.26 
 
 		 425 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  63.1 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.9 
 
 		 386 aa  474  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  60.21 
 
 		 386 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  61.1 
 
 		 386 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00049  cystathionine gamma-synthase  58.7 
 
 		 386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  60.26 
 
 		 386 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.53 
 
 		 386 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  62.04 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  60.53 
 
 		 386 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  60 
 
 		 386 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  60.53 
 
 		 386 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  60.26 
 
 		 386 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  60 
 
 		 386 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  60 
 
 		 386 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  60 
 
 		 386 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  60 
 
 		 386 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  60.53 
 
 		 386 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  60.73 
 
 		 386 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  60 
 
 		 386 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  60.57 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  63.59 
 
 		 411 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  60 
 
 		 386 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.47 
 
 		 386 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  60 
 
 		 386 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  58.44 
 
 		 387 aa  463  1e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  60.84 
 
 		 386 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002306  cystathionine gamma-synthase  57.4 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  59.06 
 
 		 388 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.7 
 
 		 385 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.05 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.56 
 
 		 422 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  56.65 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.26 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.12 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  53.93 
 
 		 385 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.39 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  50.27 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 426 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  48.42 
 
 		 382 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  48.8 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 		 426 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  48.01 
 
 		 378 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  48.94 
 
 		 378 aa  361  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  49.08 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  49.74 
 
 		 381 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  49.07 
 
 		 379 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  47.51 
 
 		 379 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  49.73 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  45.89 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  47.76 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  45.24 
 
 		 398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  44.95 
 
 		 401 aa  343  4e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2620  cystathionine gamma-synthase  45.99 
 
 		 382 aa  342  7e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  45.48 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  46.89 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  45.62 
 
 		 389 aa  339  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  47.24 
 
 		 383 aa  339  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  44.68 
 
 		 381 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  43.49 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  44.33 
 
 		 380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  47.14 
 
 		 387 aa  336  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  48.15 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  47.21 
 
 		 397 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  44.72 
 
 		 390 aa  334  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  45.18 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  47.34 
 
 		 388 aa  333  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  47.87 
 
 		 390 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  45.18 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  44.41 
 
 		 378 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  46.17 
 
 		 387 aa  332  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  43.5 
 
 		 384 aa  332  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  45.81 
 
 		 386 aa  332  5e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  44.59 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  44.74 
 
 		 390 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  44.59 
 
 		 377 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  44.59 
 
 		 377 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>