More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0177 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  86.75 
 
 		 386 aa  690    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  87.01 
 
 		 386 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  90.67 
 
 		 386 aa  724    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  84.97 
 
 		 386 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  85.97 
 
 		 386 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  85.97 
 
 		 386 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  90.67 
 
 		 386 aa  718    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  87.01 
 
 		 386 aa  691    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  87.01 
 
 		 386 aa  691    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  87.01 
 
 		 386 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  85.71 
 
 		 386 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  85.45 
 
 		 386 aa  686    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  85.97 
 
 		 386 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  86.75 
 
 		 386 aa  689    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  85.97 
 
 		 386 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  85.23 
 
 		 413 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 386 aa  790    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  97.67 
 
 		 425 aa  775    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  85.49 
 
 		 386 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  87.01 
 
 		 386 aa  691    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  86.49 
 
 		 386 aa  687    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  86.75 
 
 		 386 aa  690    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  85.49 
 
 		 386 aa  660    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  73.25 
 
 		 387 aa  590  1e-167  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00049  cystathionine gamma-synthase  60.16 
 
 		 386 aa  501  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002306  cystathionine gamma-synthase  57.66 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  62.3 
 
 		 386 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2747  cystathionine gamma-synthase  59.79 
 
 		 388 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  59.89 
 
 		 388 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.73 
 
 		 387 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.52 
 
 		 390 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.73 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.78 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.8 
 
 		 386 aa  471  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.73 
 
 		 387 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.73 
 
 		 387 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.89 
 
 		 388 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.73 
 
 		 387 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  60.47 
 
 		 393 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.47 
 
 		 388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  59.95 
 
 		 393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  60.21 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  60.99 
 
 		 393 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  59.58 
 
 		 386 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  58.65 
 
 		 388 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  58.24 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  57.84 
 
 		 405 aa  450  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  57.57 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  58.51 
 
 		 422 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  59.3 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.85 
 
 		 385 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.51 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  59.22 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  57.52 
 
 		 390 aa  421  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.04 
 
 		 386 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.03 
 
 		 385 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.53 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  48.51 
 
 		 386 aa  363  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  50.26 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  46.07 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  46.22 
 
 		 383 aa  360  3e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  47.86 
 
 		 378 aa  358  6e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 426 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  49.21 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  47.47 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2620  cystathionine gamma-synthase  47.52 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  44.97 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  46.95 
 
 		 378 aa  339  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  48.01 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  44.39 
 
 		 378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  45.89 
 
 		 394 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  45 
 
 		 388 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  44.27 
 
 		 380 aa  328  9e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  47.09 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  46.15 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  45.21 
 
 		 387 aa  325  8.000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  44.3 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  43.8 
 
 		 380 aa  324  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  44.68 
 
 		 387 aa  324  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  44.59 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  42.18 
 
 		 384 aa  322  5e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  44.27 
 
 		 377 aa  322  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  46.96 
 
 		 386 aa  322  6e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.09 
 
 		 402 aa  322  7e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  43.04 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  45 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  45 
 
 		 390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  43.88 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  44.59 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  42.55 
 
 		 381 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  45.74 
 
 		 381 aa  319  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  46.03 
 
 		 391 aa  318  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  45.19 
 
 		 379 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  44.8 
 
 		 378 aa  318  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  44.03 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  44.62 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  43.12 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  43.24 
 
 		 398 aa  315  6e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  41.49 
 
 		 385 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  44.68 
 
 		 389 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>