More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3154 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 390 aa  777    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  67.46 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  67.63 
 
 		 385 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  66.22 
 
 		 422 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  65.16 
 
 		 385 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  65.34 
 
 		 385 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  67.11 
 
 		 386 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  67.77 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  58.24 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  58.24 
 
 		 386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  57.98 
 
 		 386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  58.24 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  58.24 
 
 		 386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  60.92 
 
 		 386 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  57.14 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  57.14 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  57.71 
 
 		 386 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.71 
 
 		 386 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  57.71 
 
 		 386 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  60.92 
 
 		 413 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.14 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.88 
 
 		 387 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.88 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  57.98 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.65 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.14 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  60.65 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  57.71 
 
 		 386 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  56.61 
 
 		 393 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  57.71 
 
 		 386 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.75 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  57.71 
 
 		 386 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.61 
 
 		 387 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  57.98 
 
 		 386 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  57.49 
 
 		 386 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  57.14 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.08 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  57.59 
 
 		 425 aa  435  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  57.18 
 
 		 386 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  57.71 
 
 		 386 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  57.07 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.26 
 
 		 386 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.08 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  55.64 
 
 		 386 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  57.03 
 
 		 405 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00049  cystathionine gamma-synthase  53.7 
 
 		 386 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.86 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002306  cystathionine gamma-synthase  52.91 
 
 		 387 aa  424  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2747  cystathionine gamma-synthase  53.97 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  53.85 
 
 		 386 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  59.52 
 
 		 411 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  53.4 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  54.11 
 
 		 388 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  57.78 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  57.37 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  53.59 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  52.83 
 
 		 388 aa  401  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  53.05 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  49.19 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2620  cystathionine gamma-synthase  54.08 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  54.26 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  54.26 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  54.42 
 
 		 426 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  47.86 
 
 		 378 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  50 
 
 		 390 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  52.02 
 
 		 394 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  54.09 
 
 		 426 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  51.75 
 
 		 394 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  49.22 
 
 		 390 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  48.24 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  45.87 
 
 		 378 aa  345  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  47.88 
 
 		 388 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  47.98 
 
 		 392 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  46.88 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  44.29 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  45.15 
 
 		 385 aa  325  9e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  47.73 
 
 		 397 aa  325  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  44.69 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  47.98 
 
 		 381 aa  322  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  46.65 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  46.58 
 
 		 386 aa  315  6e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  47.28 
 
 		 394 aa  315  7e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  44.54 
 
 		 380 aa  314  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  45.5 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  44.54 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  48.75 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  44.72 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  42.23 
 
 		 400 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  44.72 
 
 		 387 aa  312  7.999999999999999e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  47.75 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  44.09 
 
 		 387 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  43.48 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  44.92 
 
 		 377 aa  310  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  43.78 
 
 		 378 aa  308  9e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  47.47 
 
 		 390 aa  308  9e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  45.18 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  44.68 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  43.75 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  43.61 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>