More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3903 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  92.56 
 
 		 393 aa  754    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 390 aa  805    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  92.31 
 
 		 393 aa  753    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  92.56 
 
 		 393 aa  756    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  51.7 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  50.26 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  49.23 
 
 		 391 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  50.52 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  47.66 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  50.26 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  47.14 
 
 		 387 aa  381  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  49.48 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  47.62 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  48.68 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  48.55 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  46.98 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  46.56 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  48.55 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  47.55 
 
 		 388 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  48.18 
 
 		 390 aa  362  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  45.12 
 
 		 383 aa  361  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  47.89 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  48.28 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  47.92 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  47.23 
 
 		 378 aa  360  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  47.92 
 
 		 390 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  47.76 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  44.74 
 
 		 381 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  44.06 
 
 		 379 aa  352  7e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  47.2 
 
 		 386 aa  352  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  44.33 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  45.79 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  45.38 
 
 		 390 aa  345  7e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  44.85 
 
 		 383 aa  344  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  42.11 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  46.95 
 
 		 426 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  44.33 
 
 		 383 aa  340  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  43.47 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2601  Cystathionine gamma-synthase  44.5 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158443  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  43.42 
 
 		 380 aa  336  5e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  46.23 
 
 		 387 aa  335  7e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  43.39 
 
 		 380 aa  334  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  41.8 
 
 		 379 aa  332  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  41.64 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  43.65 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  45.1 
 
 		 383 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  43.88 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  43.86 
 
 		 390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  43.2 
 
 		 377 aa  328  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  45.36 
 
 		 378 aa  328  8e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  43.2 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  43.2 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  43.2 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  44.74 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  42.71 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  43.2 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  43.2 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 377 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  43.01 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 377 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 377 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 377 aa  325  9e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  44.76 
 
 		 394 aa  325  9e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  42.86 
 
 		 401 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  45.26 
 
 		 383 aa  324  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  46.21 
 
 		 387 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  42.06 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  45.79 
 
 		 388 aa  322  7e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  44.85 
 
 		 381 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  42.89 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  42.93 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  42.97 
 
 		 380 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  42.26 
 
 		 381 aa  319  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  45.03 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.42 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.97 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0667  Cystathionine gamma-synthase  45.53 
 
 		 381 aa  318  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  44.65 
 
 		 384 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  43.49 
 
 		 387 aa  315  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  42.59 
 
 		 394 aa  315  7e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  43.49 
 
 		 387 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  42.94 
 
 		 387 aa  315  9e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  43.77 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  43.77 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  43.77 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  43.77 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  42.3 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 		 392 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  43.21 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 		 392 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 		 392 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  43.49 
 
 		 387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  42.59 
 
 		 392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  42.66 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  42.94 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  41.95 
 
 		 379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  40.53 
 
 		 380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  40.53 
 
 		 380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  43.59 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  42.67 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>