More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1831 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
381 aa  780    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  74.27 
 
 
378 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  74.27 
 
 
377 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  73.21 
 
 
378 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  68.44 
 
 
378 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  68.7 
 
 
377 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  68.44 
 
 
377 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  60.32 
 
 
394 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  59.58 
 
 
392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  58.65 
 
 
387 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  58.24 
 
 
387 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  57.18 
 
 
387 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  57.18 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  57.18 
 
 
387 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  57.18 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  57.18 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  57.18 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  56.91 
 
 
387 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  56.65 
 
 
387 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  55.85 
 
 
387 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  52.42 
 
 
377 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  51.61 
 
 
377 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  52.42 
 
 
377 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  51.88 
 
 
377 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  52.15 
 
 
377 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  52.15 
 
 
377 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  52.15 
 
 
377 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  51.61 
 
 
377 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  51.61 
 
 
377 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  51.61 
 
 
377 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  52.82 
 
 
378 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  51.34 
 
 
377 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  50.81 
 
 
386 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  51.34 
 
 
378 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  52.42 
 
 
377 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1990  cystathionine beta-lyase  53.44 
 
 
383 aa  418  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.916692  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  51.33 
 
 
377 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 
381 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2009  Cystathionine gamma-lyase  49.2 
 
 
382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35589e-20 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 
384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2218  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  49.47 
 
 
382 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154944  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  50.54 
 
 
388 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  49.6 
 
 
381 aa  398  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  49.46 
 
 
378 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  48.02 
 
 
381 aa  395  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  51.34 
 
 
387 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  47.47 
 
 
379 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  48.81 
 
 
383 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  48.53 
 
 
380 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  48.53 
 
 
380 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  49.46 
 
 
380 aa  393  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0766  cystathionine beta-lyase  50.95 
 
 
378 aa  392  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  52.82 
 
 
394 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  48.01 
 
 
380 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  50.53 
 
 
381 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  48.28 
 
 
376 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  52.55 
 
 
394 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1804  cystathionine beta-lyase  51.24 
 
 
379 aa  388  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.699729  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  48.81 
 
 
394 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0698  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  49.73 
 
 
391 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00027232  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  48.13 
 
 
379 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  47.87 
 
 
390 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  49.34 
 
 
401 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1982  cystathionine beta-lyase  48.82 
 
 
389 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  48.39 
 
 
384 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  48.67 
 
 
379 aa  383  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  50.8 
 
 
391 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  48.39 
 
 
384 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  48.02 
 
 
388 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  50.13 
 
 
392 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  46.95 
 
 
379 aa  377  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  48.53 
 
 
387 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  45.65 
 
 
379 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  46.77 
 
 
378 aa  373  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  47.87 
 
 
380 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.26 
 
 
387 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.75 
 
 
402 aa  368  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  47.86 
 
 
383 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  45.87 
 
 
378 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  48.79 
 
 
394 aa  368  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  48.66 
 
 
398 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  48.93 
 
 
381 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  47.21 
 
 
390 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  45.07 
 
 
380 aa  363  3e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  45.6 
 
 
385 aa  363  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  47.48 
 
 
390 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  46.65 
 
 
378 aa  362  4e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  46.81 
 
 
397 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  47.21 
 
 
390 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  46.79 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  48.79 
 
 
389 aa  354  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  47.37 
 
 
390 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  45.58 
 
 
400 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  45.87 
 
 
378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  46.03 
 
 
390 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  49.33 
 
 
390 aa  351  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  45.67 
 
 
386 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  44.44 
 
 
380 aa  349  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  45.16 
 
 
377 aa  348  7e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  44.5 
 
 
383 aa  348  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>