More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1982 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1982  cystathionine beta-lyase  100 
 
 
389 aa  798    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88245  cystathione beta lyase  51.72 
 
 
404 aa  389  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0106634  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  48.82 
 
 
381 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  50.95 
 
 
394 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  51.12 
 
 
377 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  51.12 
 
 
377 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  50.56 
 
 
377 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  50.56 
 
 
377 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  50.84 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  50.84 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  50.56 
 
 
377 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  48.56 
 
 
378 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  50.84 
 
 
377 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  50.56 
 
 
377 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  50 
 
 
377 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  50.56 
 
 
387 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  48.38 
 
 
378 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  50.28 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  48.94 
 
 
379 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  50.56 
 
 
392 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  49.73 
 
 
377 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  50.28 
 
 
387 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  49.45 
 
 
387 aa  364  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  47.48 
 
 
377 aa  364  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  47.77 
 
 
378 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  50 
 
 
387 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  49.45 
 
 
387 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  46.95 
 
 
378 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  49.45 
 
 
387 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  50.28 
 
 
387 aa  363  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  49.45 
 
 
387 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1990  cystathionine beta-lyase  49.09 
 
 
383 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.916692  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  49.45 
 
 
387 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 
381 aa  363  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  49.72 
 
 
387 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  47.52 
 
 
380 aa  360  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54505  cystathionine beta-lyase  47.25 
 
 
411 aa  358  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.383693  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  46.84 
 
 
380 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  47.09 
 
 
379 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  46.84 
 
 
380 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  48.29 
 
 
377 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  45.43 
 
 
380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07051  Cystathionine beta-lyase (EC 4.4.1.8) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q12607]  51.5 
 
 
458 aa  356  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664364  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.77 
 
 
377 aa  356  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  48.03 
 
 
387 aa  354  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  48.2 
 
 
381 aa  353  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  47.4 
 
 
381 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  46.72 
 
 
378 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  47.4 
 
 
384 aa  350  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  45.92 
 
 
386 aa  349  4e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  45.24 
 
 
392 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  45.12 
 
 
379 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2218  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.28 
 
 
382 aa  346  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  46.69 
 
 
376 aa  346  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  47.78 
 
 
390 aa  346  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  47.09 
 
 
387 aa  346  5e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2009  Cystathionine gamma-lyase  45.74 
 
 
382 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35589e-20 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  45.33 
 
 
377 aa  342  5e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0766  cystathionine beta-lyase  47.9 
 
 
378 aa  342  5e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  47.62 
 
 
380 aa  342  5.999999999999999e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  45.12 
 
 
401 aa  342  7e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  47.19 
 
 
377 aa  340  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  48.22 
 
 
900 aa  340  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  46.11 
 
 
383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  45.09 
 
 
378 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  49.74 
 
 
387 aa  339  4e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  49.44 
 
 
386 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  47.78 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  45.77 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  45.17 
 
 
384 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1804  cystathionine beta-lyase  49.29 
 
 
379 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.699729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  44.41 
 
 
378 aa  336  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  48.42 
 
 
389 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  44.65 
 
 
384 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.5 
 
 
402 aa  332  9e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  45.56 
 
 
386 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  45.14 
 
 
380 aa  331  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  46.28 
 
 
387 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  47.78 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  43.39 
 
 
378 aa  327  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  46.44 
 
 
383 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  47.41 
 
 
381 aa  326  5e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  47.96 
 
 
381 aa  325  7e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  43.24 
 
 
381 aa  325  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  47.85 
 
 
383 aa  325  8.000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  46.17 
 
 
393 aa  325  9e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  43.77 
 
 
378 aa  323  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  46.07 
 
 
397 aa  323  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  47.08 
 
 
379 aa  323  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 
381 aa  322  6e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  43.16 
 
 
385 aa  322  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  47.03 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  43.12 
 
 
380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  45.24 
 
 
387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  45.26 
 
 
386 aa  320  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  42.52 
 
 
400 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  43.24 
 
 
388 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  49.58 
 
 
383 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  45 
 
 
378 aa  318  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  45.36 
 
 
392 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>