More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54505 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_54505  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 411 aa  857    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.383693  normal  0.155514 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07051  Cystathionine beta-lyase (EC 4.4.1.8) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q12607]  60.91 
 
 		 458 aa  511  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664364  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  52.14 
 
 		 900 aa  428  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1982  cystathionine beta-lyase  47.25 
 
 		 389 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88245  cystathione beta lyase  42.42 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0106634  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  41.1 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  43.38 
 
 		 377 aa  306  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  43.38 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  43.1 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  43.1 
 
 		 377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  43.1 
 
 		 377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  43.1 
 
 		 377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  43.1 
 
 		 377 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 377 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  42.25 
 
 		 377 aa  301  9e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  39.27 
 
 		 386 aa  299  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  39.62 
 
 		 378 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  40.82 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  38.96 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  38.96 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.19 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  38.96 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  40.06 
 
 		 383 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  38.79 
 
 		 392 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  39.84 
 
 		 378 aa  285  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 377 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  39.52 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 		 386 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.41 
 
 		 388 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  40.95 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  39.4 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  37.23 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  39.31 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  39.15 
 
 		 381 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  38.67 
 
 		 378 aa  278  9e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.97 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.97 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  37.43 
 
 		 393 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.97 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  41.44 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.97 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  39.17 
 
 		 379 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  37.57 
 
 		 378 aa  276  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.97 
 
 		 387 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  37.97 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  37.17 
 
 		 393 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  37.57 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  38.67 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  38.76 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2218  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40.45 
 
 		 382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154944  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  37.17 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  38.04 
 
 		 378 aa  273  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.29 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2009  Cystathionine gamma-lyase  39.72 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35589e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  36.57 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  38.44 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.8 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  39.17 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  37.84 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  37.15 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  39.52 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  39.66 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  41 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  36.34 
 
 		 388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  37.15 
 
 		 398 aa  269  7e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  38.15 
 
 		 385 aa  269  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  38.5 
 
 		 387 aa  269  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  37.99 
 
 		 401 aa  269  8.999999999999999e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  37.64 
 
 		 380 aa  268  8.999999999999999e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  37.73 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  37.73 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  37.73 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  37.73 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  37.73 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1990  cystathionine beta-lyase  38.1 
 
 		 383 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.916692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  38.27 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  37.47 
 
 		 376 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  39.44 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.17 
 
 		 385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  37.57 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  36.87 
 
 		 379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  39.39 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0416  cystathionine gamma-synthase  38.1 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  40.17 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  37.99 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0406  cystathionine gamma-synthase  38.1 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  37.4 
 
 		 377 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1762  methionine gamma-lyase (L-methioninase)  39.01 
 
 		 380 aa  266  7e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000846941  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0766  cystathionine beta-lyase  36.83 
 
 		 378 aa  266  7e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  37.17 
 
 		 377 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  37.73 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  37.43 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  39.23 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.28 
 
 		 387 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  40.56 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  37.27 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  39.5 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  37.47 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>