More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0520 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  82.08 
 
 		 387 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  84.75 
 
 		 388 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  85.71 
 
 		 386 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  82.08 
 
 		 387 aa  656    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  83.12 
 
 		 393 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  86.7 
 
 		 386 aa  681    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  81.56 
 
 		 387 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  100 
 
 		 388 aa  790    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  83.64 
 
 		 393 aa  673    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  82.86 
 
 		 393 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  82.22 
 
 		 389 aa  663    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  82.08 
 
 		 387 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  83.12 
 
 		 393 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  81.82 
 
 		 387 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  82.6 
 
 		 386 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  77.23 
 
 		 390 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  64.92 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  64.66 
 
 		 400 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  61.17 
 
 		 388 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  63.95 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  64.94 
 
 		 411 aa  485  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  60.89 
 
 		 386 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.68 
 
 		 386 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  61.68 
 
 		 386 aa  475  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2747  cystathionine gamma-synthase  60.47 
 
 		 388 aa  478  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  61.68 
 
 		 386 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  61.42 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  61.68 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  61.15 
 
 		 386 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  61.42 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  61.42 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  61.42 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  61.42 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  61.42 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.76 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  61.15 
 
 		 386 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  60.89 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  61.42 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  61.42 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  60.73 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  61.15 
 
 		 386 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  60.63 
 
 		 425 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  60.99 
 
 		 386 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  60.73 
 
 		 386 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00049  cystathionine gamma-synthase  58.62 
 
 		 386 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.63 
 
 		 386 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002306  cystathionine gamma-synthase  57.82 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  58.42 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.9 
 
 		 385 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  58.89 
 
 		 388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  56.08 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.67 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.33 
 
 		 386 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.93 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  53.44 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  52.77 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.69 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  50.54 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  51.87 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  51.34 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  51.6 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  47.47 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  49.09 
 
 		 381 aa  358  9e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  47.47 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  47.23 
 
 		 394 aa  355  7.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  47.51 
 
 		 379 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  47.04 
 
 		 378 aa  350  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  47.93 
 
 		 390 aa  349  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2620  cystathionine gamma-synthase  47.87 
 
 		 382 aa  348  8e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  47.64 
 
 		 380 aa  344  1e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  44.65 
 
 		 380 aa  343  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  44.94 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  46.84 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  45.91 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  45.4 
 
 		 377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  45.4 
 
 		 377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  45.38 
 
 		 381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  46.84 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  46.54 
 
 		 380 aa  339  4e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  48.28 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  45.67 
 
 		 387 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  44.36 
 
 		 401 aa  339  5.9999999999999996e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  47.09 
 
 		 389 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  45.4 
 
 		 377 aa  338  7e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  44.47 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  47.71 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  45.13 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  45.13 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  44.85 
 
 		 377 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  47.73 
 
 		 379 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  45.58 
 
 		 381 aa  335  9e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  44.85 
 
 		 377 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  44.57 
 
 		 377 aa  334  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  46.65 
 
 		 378 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  44.24 
 
 		 378 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  47.35 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  44.57 
 
 		 377 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  44.57 
 
 		 377 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  48.54 
 
 		 397 aa  332  5e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>