More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3986 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 390 aa  796    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  57.69 
 
 		 392 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  56.23 
 
 		 379 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  56.15 
 
 		 379 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  53.7 
 
 		 381 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  53.7 
 
 		 380 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  56.32 
 
 		 378 aa  428  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  52.05 
 
 		 380 aa  428  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  53.24 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  51.32 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  53.97 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  53.17 
 
 		 381 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  54.01 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  411  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  51.72 
 
 		 378 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  411  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  51.06 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  52.51 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  51.07 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  51.07 
 
 		 377 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  51.07 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  51.07 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  51.35 
 
 		 390 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  52.51 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  54.79 
 
 		 380 aa  408  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  51.35 
 
 		 390 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  50.54 
 
 		 390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  50.96 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  53.01 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  52.07 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  51.98 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  51.58 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  52.34 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  50.53 
 
 		 387 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  51.05 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  50.53 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  50.26 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  53.95 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.27 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  49.46 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  51.71 
 
 		 380 aa  388  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  53.55 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  50.27 
 
 		 402 aa  388  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  51.25 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  50.55 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  51.86 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  51.52 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  50.68 
 
 		 387 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  52.33 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  51.06 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  51.06 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  51.06 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  47.49 
 
 		 392 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  51.44 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  49.33 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  50.55 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  46.63 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  47.62 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  50.65 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  51.06 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  48.95 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  49.06 
 
 		 378 aa  368  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  47.26 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  51.64 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  51.24 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  50.8 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  47.71 
 
 		 378 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  50.8 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  47.53 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  50.96 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  47.21 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  49.18 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2601  Cystathionine gamma-synthase  50.68 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  51.38 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  49.34 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  45.26 
 
 		 383 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  47.5 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  49.32 
 
 		 386 aa  364  2e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  48.92 
 
 		 379 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  46.17 
 
 		 378 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  51.96 
 
 		 387 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  47.23 
 
 		 377 aa  362  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 		 378 aa  362  8e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  46.17 
 
 		 381 aa  362  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  46.44 
 
 		 380 aa  361  9e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  46.44 
 
 		 380 aa  361  9e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  48.63 
 
 		 376 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  49.74 
 
 		 384 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  49.09 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  46.68 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  46.03 
 
 		 381 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  49.73 
 
 		 386 aa  358  6e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  47.93 
 
 		 388 aa  358  8e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  47.62 
 
 		 378 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  46.42 
 
 		 426 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>