More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1227 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 384 aa  782    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  65.08 
 
 		 384 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  65.34 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  64.3 
 
 		 387 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  58.6 
 
 		 378 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  56 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  56 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  55.73 
 
 		 377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  55.73 
 
 		 377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  55.73 
 
 		 377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  55.73 
 
 		 377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  55.47 
 
 		 377 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  55.73 
 
 		 377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  55.47 
 
 		 377 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  54.93 
 
 		 377 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  54.93 
 
 		 377 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  57.07 
 
 		 380 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  56.72 
 
 		 377 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  55.97 
 
 		 380 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  51.87 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  53.48 
 
 		 379 aa  419  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  52.27 
 
 		 377 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  50.26 
 
 		 381 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  53.05 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  51.47 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  52.53 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  52.69 
 
 		 379 aa  409  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 378 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  53.35 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  53.7 
 
 		 380 aa  408  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  50.53 
 
 		 378 aa  398  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  50.4 
 
 		 383 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2009  Cystathionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35589e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2218  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  49.6 
 
 		 382 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154944  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  50.66 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  50.4 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3997  cystathionine gamma-synthase  50.66 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4007  cystathionine gamma-synthase  50.66 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  50.93 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1762  methionine gamma-lyase (L-methioninase)  52.76 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000846941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  50.8 
 
 		 387 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  49.07 
 
 		 378 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  49.6 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  49.87 
 
 		 381 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4336  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 		 381 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4158  cystathionine gamma-synthase  50.39 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 387 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4276  cystathionine gamma-synthase  50.39 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  49.47 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4480  cystathionine gamma-synthase  50.39 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0801  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0864  cystathionine gamma-synthase  50.39 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4370  cystathionine gamma-synthase  50.66 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  51.59 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  50.27 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  50 
 
 		 387 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4389  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4110  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  49.6 
 
 		 378 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  48.18 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 380 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  49.6 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0698  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  51.1 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00027232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 380 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  48.67 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  49.2 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  49.44 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  48.53 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1990  cystathionine beta-lyase  48.92 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.916692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2985  cystathionine gamma-synthase  48.56 
 
 		 370 aa  381  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  49.6 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  48.28 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  49.09 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  49.07 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  49.46 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  48.26 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  48.54 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.27 
 
 		 377 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1667  cystathionine gamma-synthase  49.33 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  46.67 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  48.28 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  49.2 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  48.01 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  48.14 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  46.52 
 
 		 385 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  46.88 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  48.54 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  47.66 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  49.2 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  48.28 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  48.56 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  49.48 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  47.75 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  47.75 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>