More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0944 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 377 aa  763    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0698  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  89.84 
 
 		 391 aa  668    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00027232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  80.32 
 
 		 381 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  77.93 
 
 		 378 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  77.39 
 
 		 383 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2218  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  77.19 
 
 		 382 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2009  Cystathionine gamma-lyase  77.19 
 
 		 382 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35589e-20 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  61.8 
 
 		 378 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  57.87 
 
 		 386 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  58.51 
 
 		 376 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  56.65 
 
 		 388 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  54.81 
 
 		 378 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  53.61 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  53.61 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  53.61 
 
 		 377 aa  428  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  53.61 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  53.61 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  53.33 
 
 		 377 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  53.61 
 
 		 377 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  53.33 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  53.61 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  53.33 
 
 		 377 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  55.31 
 
 		 377 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  52.89 
 
 		 377 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  52.27 
 
 		 384 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  51.06 
 
 		 378 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  52.94 
 
 		 378 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  51.33 
 
 		 381 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  53.01 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  51.6 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  50.8 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  51.06 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  50.13 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  50.41 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  48.15 
 
 		 379 aa  388  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  50 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  50.68 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  51.6 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  49.73 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  50.53 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  50.27 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  48.41 
 
 		 381 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0801  cystathionine gamma-synthase  50.53 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  49.21 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  50 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  52.37 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  49.08 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  48.14 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  47.34 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  50.53 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  48.76 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  50.96 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  48.48 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1667  cystathionine gamma-synthase  50.93 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  50.53 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  48.8 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  48.94 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  48.48 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  48.21 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  48.21 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  48.21 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  48.21 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  48.53 
 
 		 383 aa  371  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  47.93 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  47.66 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  48.21 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  50.13 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  48.15 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  50.13 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3997  cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1990  cystathionine beta-lyase  48.67 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.916692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  45.89 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4336  cystathionine gamma-synthase  49.33 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  50.39 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4158  cystathionine gamma-synthase  49.2 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4007  cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  45.77 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  49.07 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0864  cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4480  cystathionine gamma-synthase  49.2 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  48.4 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4276  cystathionine gamma-synthase  49.2 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  45.07 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  46.09 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4370  cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  46.56 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4389  cystathionine gamma-synthase  49.2 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  48.4 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  48.13 
 
 		 390 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  46.56 
 
 		 387 aa  364  2e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  47.09 
 
 		 387 aa  363  2e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  45.09 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  47.48 
 
 		 378 aa  363  3e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  45.09 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  49.2 
 
 		 394 aa  363  4e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  48.28 
 
 		 381 aa  362  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  50.8 
 
 		 387 aa  362  7.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  46.26 
 
 		 382 aa  361  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  48.4 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>