More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2908 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  100 
 
 
379 aa  790    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  67.72 
 
 
379 aa  558  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  65.17 
 
 
380 aa  545  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  65.34 
 
 
379 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  61.11 
 
 
381 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  61.21 
 
 
380 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  59.26 
 
 
398 aa  478  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  58.47 
 
 
401 aa  475  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  55.15 
 
 
381 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  53.7 
 
 
388 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  54.79 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  54.52 
 
 
390 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  54.26 
 
 
390 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  54.76 
 
 
378 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  54.38 
 
 
390 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  56.38 
 
 
387 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.32 
 
 
387 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  53.97 
 
 
383 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  54.52 
 
 
377 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  54.5 
 
 
394 aa  432  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  53.19 
 
 
402 aa  432  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  55.56 
 
 
378 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  53.95 
 
 
397 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  52.91 
 
 
392 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  53.44 
 
 
378 aa  421  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  54.35 
 
 
387 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  53.44 
 
 
383 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  51.98 
 
 
377 aa  411  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  53.68 
 
 
383 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  51.98 
 
 
377 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  50 
 
 
392 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  50.39 
 
 
394 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  51.98 
 
 
377 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  50.53 
 
 
394 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  51.98 
 
 
377 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  51.98 
 
 
377 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  51.98 
 
 
377 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  51.72 
 
 
377 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  51.72 
 
 
377 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  53.44 
 
 
383 aa  411  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  52.38 
 
 
377 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  55 
 
 
392 aa  408  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  51.72 
 
 
377 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  53.02 
 
 
390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  51.72 
 
 
377 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  51.32 
 
 
390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  51.72 
 
 
377 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  52.53 
 
 
380 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  52.38 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  53.85 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  51.32 
 
 
379 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  51.44 
 
 
391 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  52.25 
 
 
390 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  52.38 
 
 
392 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  52.79 
 
 
393 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  52.21 
 
 
386 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  52.38 
 
 
392 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  53.17 
 
 
379 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  52.38 
 
 
392 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  51.59 
 
 
389 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  54.09 
 
 
381 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  52.65 
 
 
384 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  52.24 
 
 
381 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 
381 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  51.19 
 
 
388 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  50.52 
 
 
386 aa  389  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  48.68 
 
 
400 aa  388  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  49.21 
 
 
378 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  49.34 
 
 
381 aa  388  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  52.17 
 
 
387 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  48.54 
 
 
386 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  50 
 
 
382 aa  382  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  50.79 
 
 
387 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  49.08 
 
 
380 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  49.34 
 
 
380 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  53.83 
 
 
383 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  49.08 
 
 
380 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  49.1 
 
 
393 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  48.68 
 
 
378 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  49.6 
 
 
389 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  47.61 
 
 
392 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  49.21 
 
 
379 aa  375  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  50.4 
 
 
383 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  50.66 
 
 
387 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  48.54 
 
 
384 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  51.72 
 
 
380 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  50.26 
 
 
383 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  50.68 
 
 
383 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  48.15 
 
 
384 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  47.35 
 
 
394 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  45.65 
 
 
381 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  51.19 
 
 
385 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  49.07 
 
 
387 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  48.41 
 
 
388 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  48.15 
 
 
384 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 
386 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  47.76 
 
 
376 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  50.66 
 
 
380 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  48.7 
 
 
419 aa  363  3e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  46.17 
 
 
380 aa  363  3e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>