More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0169 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  100 
 
 
384 aa  774    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  98.7 
 
 
384 aa  765    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  65.08 
 
 
384 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  59.52 
 
 
387 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  60.11 
 
 
378 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  57.56 
 
 
377 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  57.56 
 
 
377 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  57.56 
 
 
377 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  57.56 
 
 
377 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  57.98 
 
 
377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  57.56 
 
 
377 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  57.56 
 
 
377 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  57.67 
 
 
377 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  57.29 
 
 
377 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  57.56 
 
 
377 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  57.26 
 
 
377 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  56.08 
 
 
377 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  56.72 
 
 
380 aa  428  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  55.03 
 
 
379 aa  419  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  55.56 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  53.48 
 
 
379 aa  409  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  51.72 
 
 
381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  51.89 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  53.42 
 
 
380 aa  406  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  51.06 
 
 
379 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  50.79 
 
 
388 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  51.72 
 
 
378 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  51.43 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  51.32 
 
 
380 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  50.93 
 
 
380 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  50.93 
 
 
380 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  51.06 
 
 
379 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  48.54 
 
 
378 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  50 
 
 
377 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  51.05 
 
 
390 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  49.46 
 
 
381 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  48.14 
 
 
378 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  51.12 
 
 
376 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 
387 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  47.61 
 
 
377 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 
387 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 
387 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 
387 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  49.73 
 
 
387 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  48.4 
 
 
390 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  50 
 
 
392 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 
387 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  47.07 
 
 
381 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  50.8 
 
 
397 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  49.74 
 
 
381 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  48.93 
 
 
387 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  49.2 
 
 
387 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 
387 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  48.39 
 
 
381 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  48.4 
 
 
378 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  48.66 
 
 
387 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  49.73 
 
 
394 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 
383 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  50.81 
 
 
383 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  47.34 
 
 
378 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  47.86 
 
 
378 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  48.15 
 
 
379 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  46.54 
 
 
388 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1762  methionine gamma-lyase (L-methioninase)  49.47 
 
 
380 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000846941  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  49.19 
 
 
398 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  48.27 
 
 
394 aa  369  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1990  cystathionine beta-lyase  47.21 
 
 
383 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.916692  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2218  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.79 
 
 
382 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154944  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  49.33 
 
 
390 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  47.37 
 
 
392 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4158  cystathionine gamma-synthase  49.18 
 
 
370 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3997  cystathionine gamma-synthase  49.18 
 
 
370 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4007  cystathionine gamma-synthase  49.59 
 
 
370 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0698  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  49.15 
 
 
391 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00027232  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4480  cystathionine gamma-synthase  49.18 
 
 
370 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2009  Cystathionine gamma-lyase  46.87 
 
 
382 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35589e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4276  cystathionine gamma-synthase  49.18 
 
 
370 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  46.79 
 
 
387 aa  364  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  45.89 
 
 
390 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4336  cystathionine gamma-synthase  48.91 
 
 
370 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4370  cystathionine gamma-synthase  49.32 
 
 
370 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.01 
 
 
377 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  47.18 
 
 
401 aa  361  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  45.62 
 
 
390 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4389  cystathionine gamma-synthase  48.64 
 
 
370 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  45.74 
 
 
377 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  45.09 
 
 
390 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  46.63 
 
 
385 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0864  cystathionine gamma-synthase  48.65 
 
 
370 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0801  cystathionine gamma-synthase  48.53 
 
 
367 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  50 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  46.24 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4110  cystathionine gamma-synthase  48.37 
 
 
370 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1667  cystathionine gamma-synthase  47.73 
 
 
367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.45 
 
 
402 aa  355  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  46.49 
 
 
378 aa  354  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  47.62 
 
 
378 aa  354  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  47.09 
 
 
381 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  46.13 
 
 
392 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  46.01 
 
 
387 aa  352  5.9999999999999994e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>