More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3857 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 378 aa  773    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  77.51 
 
 		 378 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  76.19 
 
 		 378 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  68.44 
 
 		 381 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  71.85 
 
 		 377 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  71.01 
 
 		 377 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  65.52 
 
 		 377 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  62.47 
 
 		 394 aa  481  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  61.33 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  58.4 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  57.6 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  57.6 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  57.6 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  57.6 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  57.6 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  58.4 
 
 		 387 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  57.33 
 
 		 387 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  57.6 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  57.6 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  55.73 
 
 		 387 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1990  cystathionine beta-lyase  57.82 
 
 		 383 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.916692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  53.19 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  52.91 
 
 		 378 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  52.39 
 
 		 377 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  52.39 
 
 		 377 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  53.99 
 
 		 378 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  55.32 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  52.13 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  52.13 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  52.13 
 
 		 377 aa  421  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  52.69 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  52.13 
 
 		 377 aa  423  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  52.69 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  52.13 
 
 		 377 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  51.86 
 
 		 377 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  51.6 
 
 		 386 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  48.41 
 
 		 381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  51.19 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  51.6 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  48.55 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  48.81 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  50.4 
 
 		 383 aa  391  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  49.6 
 
 		 384 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0766  cystathionine beta-lyase  51.08 
 
 		 378 aa  389  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  51.32 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1804  cystathionine beta-lyase  52.34 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.699729  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  49.34 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  48.68 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  48.4 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  48.14 
 
 		 380 aa  378  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  48.68 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2218  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.62 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2009  Cystathionine gamma-lyase  47.62 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35589e-20 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  48.92 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  49.2 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  47.75 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  48.41 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  47.61 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  49.21 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  48.67 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0698  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  50.55 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00027232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  47.34 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  47.34 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  49.33 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  47.76 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  50.53 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  51.05 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  48.4 
 
 		 387 aa  365  1e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1982  cystathionine beta-lyase  46.95 
 
 		 389 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.13 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  48.81 
 
 		 398 aa  362  4e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  49.07 
 
 		 401 aa  362  8e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  49.6 
 
 		 394 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  46.44 
 
 		 380 aa  358  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  46.92 
 
 		 382 aa  358  7e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  45.91 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  49.6 
 
 		 392 aa  355  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  48.01 
 
 		 386 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  47.44 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  47.71 
 
 		 390 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  49.07 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  47.49 
 
 		 397 aa  352  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  46.9 
 
 		 388 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  47.44 
 
 		 390 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  47.49 
 
 		 381 aa  352  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  48.67 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  51.07 
 
 		 390 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  43.27 
 
 		 380 aa  349  4e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  44.03 
 
 		 385 aa  348  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  45.12 
 
 		 380 aa  346  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  46.4 
 
 		 390 aa  345  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.06 
 
 		 402 aa  345  8.999999999999999e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  46.01 
 
 		 400 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  47.53 
 
 		 386 aa  342  8e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  47.89 
 
 		 390 aa  341  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  43.01 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  47.07 
 
 		 383 aa  335  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>