More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1667 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 386 aa  793    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  59.15 
 
 		 383 aa  471  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  59.26 
 
 		 378 aa  464  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  58.85 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  58.27 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  58.01 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  58.12 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  55.29 
 
 		 382 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  53.17 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  55.01 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  52.14 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  55.59 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  55.59 
 
 		 394 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  54.47 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  54.47 
 
 		 390 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  53.07 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  52.91 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  53.12 
 
 		 388 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  50.93 
 
 		 378 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  52.14 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  52.14 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  53.66 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  52.41 
 
 		 402 aa  388  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  51.09 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  51.06 
 
 		 377 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  52.93 
 
 		 383 aa  388  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  52.93 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 		 378 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  50.53 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  50.4 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  52.85 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  50.53 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  50.53 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.81 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  50.53 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  50.53 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  50.82 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.27 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.37 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.27 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  52.14 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  49.86 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  50.26 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  53.58 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  50 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  51.2 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  54.45 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.27 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  51.2 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  50.54 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  50.27 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.54 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.27 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  52.79 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  51.2 
 
 		 383 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  51.07 
 
 		 381 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  52.57 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.27 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  53.05 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  49.07 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  52.57 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  49.32 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  48.83 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  50 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  48.81 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  50.55 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  52.97 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  51.33 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  53.87 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  52.41 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  48.28 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  47.88 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  51.17 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2218  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  49.47 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.53 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  53.17 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  49.6 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  49.32 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  52.7 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  48.16 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  49.18 
 
 		 389 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2009  Cystathionine gamma-lyase  48.94 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35589e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  49.05 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  52.48 
 
 		 411 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  53.37 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  49.05 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2747  cystathionine gamma-synthase  48.41 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  49.08 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  49.05 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>