More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3551 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  85.71 
 
 		 386 aa  684    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  88.37 
 
 		 393 aa  689    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  87.08 
 
 		 387 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  85.41 
 
 		 386 aa  677    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  85.71 
 
 		 388 aa  690    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  82.22 
 
 		 388 aa  663    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  87.08 
 
 		 387 aa  698    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  87.34 
 
 		 387 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  87.34 
 
 		 387 aa  702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  87.86 
 
 		 393 aa  704    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  87.08 
 
 		 393 aa  697    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  100 
 
 		 389 aa  795    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  87.86 
 
 		 393 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  84.68 
 
 		 386 aa  683    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  87.6 
 
 		 387 aa  701    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  77 
 
 		 390 aa  618  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  62.73 
 
 		 388 aa  501  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2747  cystathionine gamma-synthase  60.05 
 
 		 388 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  62.37 
 
 		 405 aa  481  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  62.2 
 
 		 400 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  61.04 
 
 		 386 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  61.36 
 
 		 386 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.62 
 
 		 386 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  62.08 
 
 		 405 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  61.36 
 
 		 386 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  61.62 
 
 		 386 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  61.36 
 
 		 386 aa  474  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  61.62 
 
 		 386 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  60.78 
 
 		 386 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00049  cystathionine gamma-synthase  58.44 
 
 		 386 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  63.14 
 
 		 411 aa  475  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  61.62 
 
 		 386 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  60.84 
 
 		 386 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  61.1 
 
 		 386 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  60.84 
 
 		 386 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.54 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  60 
 
 		 425 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  60.84 
 
 		 386 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  61.1 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  60.57 
 
 		 386 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  59.17 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  60.57 
 
 		 386 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.52 
 
 		 386 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  61.8 
 
 		 386 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  61.54 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002306  cystathionine gamma-synthase  56.62 
 
 		 387 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  60.26 
 
 		 386 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  61.27 
 
 		 386 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  58.01 
 
 		 387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.05 
 
 		 385 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.12 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.73 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  56.08 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.59 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.91 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.44 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  53.26 
 
 		 385 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  48.26 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  49.18 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 378 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  48.54 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  49.21 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  48.69 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  48.43 
 
 		 426 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  49.07 
 
 		 379 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  48.42 
 
 		 379 aa  354  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  47.71 
 
 		 381 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  47.61 
 
 		 389 aa  344  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  45.72 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  47.45 
 
 		 380 aa  342  5e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  46.26 
 
 		 394 aa  342  5.999999999999999e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  45.58 
 
 		 401 aa  342  5.999999999999999e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2620  cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 		 382 aa  342  7e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  46.11 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  45.87 
 
 		 379 aa  339  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  47.12 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  45.26 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  45.81 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  43.88 
 
 		 380 aa  336  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  46.72 
 
 		 426 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  45.84 
 
 		 380 aa  332  6e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  45.43 
 
 		 386 aa  332  8e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  44 
 
 		 388 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  47.24 
 
 		 383 aa  331  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  46.42 
 
 		 383 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  44.85 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  44.59 
 
 		 394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  44.47 
 
 		 381 aa  328  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  47.61 
 
 		 380 aa  328  9e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  45.41 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  44.74 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  47.93 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.27 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  47.04 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  46.54 
 
 		 378 aa  326  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  46.42 
 
 		 392 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  46.42 
 
 		 392 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  46.42 
 
 		 392 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  44.8 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  44.47 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>