More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0920 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  95.26 
 
 		 380 aa  706    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 380 aa  768    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  77.11 
 
 		 379 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  76.58 
 
 		 379 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  74.14 
 
 		 387 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  75.27 
 
 		 387 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  71.09 
 
 		 381 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  74.01 
 
 		 384 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  73.16 
 
 		 383 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  70.11 
 
 		 392 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  73.47 
 
 		 381 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  69.39 
 
 		 383 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  68.52 
 
 		 389 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  65.96 
 
 		 383 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  65.63 
 
 		 393 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  65.7 
 
 		 390 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  64.91 
 
 		 387 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  69.58 
 
 		 385 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  64.38 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  65.73 
 
 		 411 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  65.3 
 
 		 383 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  64.38 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  64.38 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  61.64 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  61.64 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  64.74 
 
 		 406 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  62.7 
 
 		 388 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  62.07 
 
 		 390 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  62.07 
 
 		 393 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  61.21 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1055  Cystathionine gamma-synthase  63.78 
 
 		 413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  60.99 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  56.51 
 
 		 386 aa  422  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  56.69 
 
 		 378 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  53.03 
 
 		 380 aa  408  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  54.52 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  54.33 
 
 		 398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  54.97 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  55.03 
 
 		 381 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  54.33 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  53.66 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  54.35 
 
 		 379 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  53.97 
 
 		 388 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  53.83 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  53.83 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  54.09 
 
 		 390 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  54.74 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  54.5 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  51.84 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17590  cystathionine gamma-lyase  56.59 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  52.76 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  52.23 
 
 		 383 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  52.37 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  54.95 
 
 		 381 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  52.91 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  54.76 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  53.93 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  50.66 
 
 		 379 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  52.25 
 
 		 378 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  50.92 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  52.22 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  51.83 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  50.26 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  52.59 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  50.39 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  50.79 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  53.7 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  51.97 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  50.13 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  50.4 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  50.4 
 
 		 378 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  50.13 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  49.6 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 377 aa  364  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 377 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 377 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  49.6 
 
 		 377 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 377 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  51.71 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  51.75 
 
 		 386 aa  363  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  49.6 
 
 		 377 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  49.34 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  49.6 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  50.26 
 
 		 419 aa  357  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  50.53 
 
 		 380 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 376 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  53.07 
 
 		 372 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  52.62 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  45.5 
 
 		 392 aa  349  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.53 
 
 		 386 aa  349  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  48.54 
 
 		 387 aa  348  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  50.53 
 
 		 377 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  47.35 
 
 		 383 aa  347  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  49.59 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  48.82 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  53.46 
 
 		 380 aa  346  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  52.88 
 
 		 390 aa  346  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  46.44 
 
 		 390 aa  346  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  47.61 
 
 		 389 aa  345  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 		 378 aa  345  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>