More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5399 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  99.22 
 
 		 386 aa  786    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  99.48 
 
 		 386 aa  786    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 386 aa  790    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  86.49 
 
 		 386 aa  687    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  96.37 
 
 		 386 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  87.01 
 
 		 386 aa  689    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  98.96 
 
 		 386 aa  784    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  96.63 
 
 		 386 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  96.63 
 
 		 386 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  83.29 
 
 		 386 aa  653    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  99.22 
 
 		 386 aa  786    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  99.48 
 
 		 386 aa  786    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  86.23 
 
 		 425 aa  687    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  85.12 
 
 		 386 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  83.03 
 
 		 413 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  99.48 
 
 		 386 aa  786    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  96.11 
 
 		 386 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  99.48 
 
 		 386 aa  788    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  99.22 
 
 		 386 aa  785    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  92.75 
 
 		 386 aa  743    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  85.45 
 
 		 386 aa  677    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  96.37 
 
 		 386 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  82.77 
 
 		 386 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  72.99 
 
 		 387 aa  582  1.0000000000000001e-165  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00049  cystathionine gamma-synthase  59.42 
 
 		 386 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.84 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2747  cystathionine gamma-synthase  60.63 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.05 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.32 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  61.58 
 
 		 393 aa  474  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.05 
 
 		 387 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.6 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  59.63 
 
 		 388 aa  471  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.05 
 
 		 387 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.1 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002306  cystathionine gamma-synthase  58.38 
 
 		 387 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  61.32 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.42 
 
 		 388 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  61.05 
 
 		 386 aa  471  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  60.79 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.47 
 
 		 388 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  60.1 
 
 		 386 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  61.58 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60 
 
 		 390 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  57.75 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  57.94 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  57.75 
 
 		 400 aa  441  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  58.73 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  59.26 
 
 		 411 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.44 
 
 		 385 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.41 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  57.26 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.29 
 
 		 422 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  58.51 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.69 
 
 		 385 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.71 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  53.03 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  49.05 
 
 		 386 aa  364  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  46.07 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  45 
 
 		 383 aa  347  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  46.52 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2620  cystathionine gamma-synthase  46.21 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  47.09 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  47.35 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  45.33 
 
 		 387 aa  328  9e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  46.65 
 
 		 394 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  44.18 
 
 		 379 aa  326  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  46.83 
 
 		 426 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  46.11 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  43.73 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  46.35 
 
 		 377 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  46.35 
 
 		 377 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.05 
 
 		 378 aa  322  7e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  46.07 
 
 		 377 aa  322  8e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  46.35 
 
 		 377 aa  322  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  46.07 
 
 		 377 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  46.07 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  46.07 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  46.07 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  44.18 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  45.53 
 
 		 378 aa  320  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  46.07 
 
 		 377 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  44.33 
 
 		 390 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  44.33 
 
 		 390 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  46.35 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  46.03 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  44.06 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  45.41 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  42.26 
 
 		 384 aa  317  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  46.56 
 
 		 426 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  43.47 
 
 		 377 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  43.54 
 
 		 380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  44.8 
 
 		 378 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  42.55 
 
 		 381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  43.58 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  44.18 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  44.88 
 
 		 379 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  42.78 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0390  cystathionine gamma-synthase  43.97 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  42.48 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>