More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0120 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  84.68 
 
 		 386 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  85.45 
 
 		 386 aa  679    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  85.71 
 
 		 386 aa  679    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  90.67 
 
 		 386 aa  718    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  84.2 
 
 		 386 aa  655    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  85.19 
 
 		 386 aa  676    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  85.71 
 
 		 386 aa  679    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  84.68 
 
 		 386 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  91.19 
 
 		 425 aa  721    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  84.46 
 
 		 413 aa  657    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  85.71 
 
 		 386 aa  679    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  92.23 
 
 		 386 aa  734    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  85.45 
 
 		 386 aa  679    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  84.72 
 
 		 386 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  84.72 
 
 		 386 aa  657    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  85.45 
 
 		 386 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  100 
 
 		 386 aa  788    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  84.68 
 
 		 386 aa  678    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  85.45 
 
 		 386 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  84.94 
 
 		 386 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  85.71 
 
 		 386 aa  679    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  84.68 
 
 		 386 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  84.94 
 
 		 386 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  74.81 
 
 		 387 aa  602  1.0000000000000001e-171  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2747  cystathionine gamma-synthase  59.53 
 
 		 388 aa  475  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00049  cystathionine gamma-synthase  57.29 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  60.73 
 
 		 386 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002306  cystathionine gamma-synthase  55.84 
 
 		 387 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.52 
 
 		 389 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  58.31 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.47 
 
 		 390 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.69 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.63 
 
 		 388 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.69 
 
 		 388 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.42 
 
 		 387 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  59.42 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.16 
 
 		 387 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.16 
 
 		 387 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.47 
 
 		 386 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.16 
 
 		 387 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  59.16 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  58.9 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  59.69 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  58.27 
 
 		 386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  58.38 
 
 		 388 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  57.57 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  57.3 
 
 		 400 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.45 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  58.44 
 
 		 411 aa  425  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.65 
 
 		 422 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  57.95 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.81 
 
 		 385 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  57.26 
 
 		 390 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.98 
 
 		 386 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.5 
 
 		 385 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.66 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.89 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  47.15 
 
 		 386 aa  348  9e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  44.24 
 
 		 382 aa  339  5.9999999999999996e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  44.59 
 
 		 383 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  45.99 
 
 		 378 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2620  cystathionine gamma-synthase  46.21 
 
 		 382 aa  328  7e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  46.83 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  43.65 
 
 		 379 aa  323  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.32 
 
 		 378 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  45.6 
 
 		 387 aa  322  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  46.56 
 
 		 426 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  45.77 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  46.95 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  42.18 
 
 		 384 aa  315  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  44.83 
 
 		 378 aa  315  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  43.2 
 
 		 380 aa  315  7e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  43.47 
 
 		 377 aa  315  9e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  44.18 
 
 		 390 aa  312  5.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  43.46 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  44.56 
 
 		 394 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  43.61 
 
 		 377 aa  308  8e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  43.61 
 
 		 377 aa  308  8e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  44.94 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  43.61 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  44.83 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  43.01 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  43.42 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  42.02 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  43.33 
 
 		 377 aa  306  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.35 
 
 		 387 aa  306  3e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0390  cystathionine gamma-synthase  42.63 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  45.71 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.5 
 
 		 402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  43.42 
 
 		 390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  43.88 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  43.33 
 
 		 377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  43.33 
 
 		 377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  43.33 
 
 		 377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  43.33 
 
 		 377 aa  305  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  43.01 
 
 		 390 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  43.33 
 
 		 377 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  44.68 
 
 		 381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  43.47 
 
 		 378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  42.63 
 
 		 388 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>