More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5069 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  100 
 
 		 385 aa  753    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  67.63 
 
 		 390 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  63.66 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  63.78 
 
 		 422 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  66.22 
 
 		 385 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  63.83 
 
 		 385 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  66.67 
 
 		 388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  63.66 
 
 		 386 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.91 
 
 		 387 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.91 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.65 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  56.91 
 
 		 386 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.38 
 
 		 387 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.38 
 
 		 387 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  53.83 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.26 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  55.85 
 
 		 393 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  55.59 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.59 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  55.85 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  56 
 
 		 386 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00049  cystathionine gamma-synthase  54.13 
 
 		 386 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2747  cystathionine gamma-synthase  55.53 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  56.12 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  56.05 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  57.1 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.93 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.2 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  56.03 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  55.41 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  56.84 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  56.84 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.1 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.5 
 
 		 386 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  57.49 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  57.58 
 
 		 405 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  57.49 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002306  cystathionine gamma-synthase  53.07 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  58.91 
 
 		 411 aa  408  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  53.89 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 		 386 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  53.03 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  53.3 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  52.01 
 
 		 388 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  53.03 
 
 		 386 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  53.35 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  52.77 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  55.41 
 
 		 386 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  53.03 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  52.35 
 
 		 386 aa  362  4e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  53.66 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  53.39 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  47.68 
 
 		 383 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  53.12 
 
 		 426 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  48.15 
 
 		 382 aa  342  5.999999999999999e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  46.87 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2620  cystathionine gamma-synthase  48.56 
 
 		 382 aa  335  9e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  50.95 
 
 		 426 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  46.63 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  48.63 
 
 		 394 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  47.65 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  48.63 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  47.37 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  47.03 
 
 		 378 aa  319  5e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  48.61 
 
 		 394 aa  318  9e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  46.7 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  45.23 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  47.73 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  47.09 
 
 		 388 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  43.13 
 
 		 385 aa  315  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  46.81 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  46.96 
 
 		 397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.89 
 
 		 378 aa  312  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  48.37 
 
 		 387 aa  311  7.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  47.88 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  49.3 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  44.09 
 
 		 401 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.29 
 
 		 402 aa  308  9e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  45.92 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  49.03 
 
 		 388 aa  307  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  48.77 
 
 		 379 aa  305  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  48.62 
 
 		 381 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  45.21 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  49.06 
 
 		 383 aa  303  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  45.08 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  48.34 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  42.19 
 
 		 377 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  47.51 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  47.51 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  47.51 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  43.01 
 
 		 387 aa  299  5e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  48.31 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>