More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3067 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  100 
 
 		 385 aa  763    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  84.28 
 
 		 388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  78.07 
 
 		 386 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  66.84 
 
 		 385 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  63.97 
 
 		 394 aa  508  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  64.23 
 
 		 422 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  66.22 
 
 		 385 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  65.34 
 
 		 390 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.9 
 
 		 388 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  58.36 
 
 		 386 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  59.38 
 
 		 386 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  58.49 
 
 		 386 aa  461  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.7 
 
 		 387 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.44 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.7 
 
 		 387 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.7 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  57.87 
 
 		 393 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  58.13 
 
 		 393 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  58.13 
 
 		 393 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.18 
 
 		 387 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  59.95 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.7 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  59.69 
 
 		 386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.05 
 
 		 389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.55 
 
 		 388 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  59.95 
 
 		 386 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  57.87 
 
 		 393 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.96 
 
 		 387 aa  448  1e-125  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  60.32 
 
 		 400 aa  448  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  57.18 
 
 		 386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  57.18 
 
 		 386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.44 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  57.44 
 
 		 386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  60.32 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  57.85 
 
 		 386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  57.33 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  57.33 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  57.44 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  57.33 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  57.44 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  57.33 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  61.1 
 
 		 411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  57.33 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  57.44 
 
 		 386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  59.42 
 
 		 386 aa  444  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  57.85 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  57.33 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00049  cystathionine gamma-synthase  55.84 
 
 		 386 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  57.18 
 
 		 386 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  57.18 
 
 		 386 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.03 
 
 		 386 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  60 
 
 		 405 aa  441  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002306  cystathionine gamma-synthase  55.32 
 
 		 387 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  55.5 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2747  cystathionine gamma-synthase  54.55 
 
 		 388 aa  428  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.81 
 
 		 386 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  53.05 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  52.41 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  55.53 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  55.26 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  55.26 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  53.78 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  48.94 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  50.26 
 
 		 394 aa  364  1e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  46.81 
 
 		 382 aa  362  7.0000000000000005e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  50.68 
 
 		 378 aa  353  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  47.34 
 
 		 379 aa  352  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2620  cystathionine gamma-synthase  50.66 
 
 		 382 aa  352  7e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  47.15 
 
 		 388 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  50 
 
 		 394 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  50.27 
 
 		 394 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  48.36 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  47.83 
 
 		 380 aa  344  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  45.71 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  45.99 
 
 		 378 aa  342  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  47.75 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  47.84 
 
 		 401 aa  339  4e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  45.97 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  47.75 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  47.04 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  50.66 
 
 		 381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  47.48 
 
 		 390 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.68 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  46.79 
 
 		 378 aa  333  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  45.8 
 
 		 387 aa  332  6e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  45 
 
 		 385 aa  332  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 379 aa  332  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  49.59 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  44.44 
 
 		 386 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  45.8 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  49.6 
 
 		 393 aa  329  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  47.33 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  46.3 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  45.75 
 
 		 380 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  51.89 
 
 		 383 aa  326  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  44.53 
 
 		 381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  47.96 
 
 		 392 aa  326  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 383 aa  326  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  43.41 
 
 		 380 aa  325  7e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>