More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1548 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  80.11 
 
 
378 aa  638    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
383 aa  795    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  59.15 
 
 
386 aa  471  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  55.76 
 
 
382 aa  444  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  56.46 
 
 
426 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  56.35 
 
 
426 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  57.45 
 
 
426 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  56.2 
 
 
426 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  54.76 
 
 
390 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  54.23 
 
 
394 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  54.11 
 
 
378 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  50.67 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  53.7 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  52.91 
 
 
379 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  51.73 
 
 
377 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  53.7 
 
 
381 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  53.44 
 
 
379 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  52.38 
 
 
379 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  50.67 
 
 
398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  53.58 
 
 
377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  49.47 
 
 
378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  52.52 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  50.67 
 
 
401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  50.94 
 
 
390 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  51.72 
 
 
381 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  51.19 
 
 
397 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  50.94 
 
 
390 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  50.66 
 
 
394 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  50.67 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  50.26 
 
 
378 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  50.4 
 
 
377 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  50.4 
 
 
377 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  50.13 
 
 
386 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 
380 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 
377 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  50.13 
 
 
377 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 
381 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  50.13 
 
 
377 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  50.13 
 
 
377 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 
377 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  50.53 
 
 
391 aa  381  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  49.07 
 
 
387 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  49.6 
 
 
387 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  49.08 
 
 
380 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 
377 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 
377 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  49.6 
 
 
383 aa  381  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 
377 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  50.13 
 
 
377 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.26 
 
 
394 aa  378  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  48.81 
 
 
378 aa  378  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.73 
 
 
402 aa  381  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 
380 aa  379  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  48.04 
 
 
386 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  49.34 
 
 
390 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  51.5 
 
 
422 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  48.54 
 
 
378 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  48.79 
 
 
393 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.79 
 
 
386 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  47.75 
 
 
380 aa  375  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  45.09 
 
 
385 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  48.53 
 
 
393 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  48.01 
 
 
380 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48 
 
 
387 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  48.53 
 
 
393 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.26 
 
 
387 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  48.27 
 
 
386 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.26 
 
 
387 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  48.26 
 
 
393 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.26 
 
 
389 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.26 
 
 
387 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  47.72 
 
 
386 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  47.47 
 
 
388 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  50.13 
 
 
383 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  49.19 
 
 
390 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.8 
 
 
390 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  47.99 
 
 
387 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  49.07 
 
 
388 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  46.95 
 
 
400 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.28 
 
 
388 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  47.76 
 
 
383 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  48.28 
 
 
381 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  48.81 
 
 
392 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  48.81 
 
 
392 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  48.81 
 
 
392 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  49.34 
 
 
389 aa  363  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  48.81 
 
 
379 aa  362  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  49.47 
 
 
385 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  48.81 
 
 
383 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  45.77 
 
 
392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  47.72 
 
 
394 aa  362  8e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  45.72 
 
 
388 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  49.07 
 
 
390 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  46.22 
 
 
386 aa  360  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  51.23 
 
 
386 aa  359  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  48.94 
 
 
390 aa  359  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  47.18 
 
 
384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  46.44 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  48.11 
 
 
386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  47.84 
 
 
386 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>