More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1264 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  100 
 
 
383 aa  790    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  74.34 
 
 
378 aa  599  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  71.2 
 
 
400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  69.47 
 
 
380 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0667  Cystathionine gamma-synthase  74.93 
 
 
381 aa  554  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  58.99 
 
 
378 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  53.33 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  54.23 
 
 
390 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  51.97 
 
 
388 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  51.19 
 
 
379 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  51.45 
 
 
390 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  51.45 
 
 
390 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  51.19 
 
 
390 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  51.32 
 
 
381 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  53.02 
 
 
387 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  50.26 
 
 
379 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 
378 aa  388  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  50.4 
 
 
377 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  51.98 
 
 
383 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  51.72 
 
 
387 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  50.4 
 
 
392 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  50 
 
 
381 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.79 
 
 
387 aa  383  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  50.27 
 
 
390 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  50.4 
 
 
392 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  50.4 
 
 
392 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  48.26 
 
 
386 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  47.76 
 
 
378 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  53.99 
 
 
390 aa  381  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  52.27 
 
 
397 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  48.42 
 
 
394 aa  375  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  52.25 
 
 
394 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  50.26 
 
 
386 aa  377  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  49.34 
 
 
393 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  51.99 
 
 
394 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  47.88 
 
 
379 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  51.19 
 
 
392 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  48.81 
 
 
383 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 
388 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  48.56 
 
 
382 aa  372  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  49.34 
 
 
381 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  50.26 
 
 
379 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  47.52 
 
 
386 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  49.61 
 
 
378 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  47.48 
 
 
385 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 
389 aa  368  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  49.34 
 
 
390 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  50.93 
 
 
381 aa  364  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  48.41 
 
 
383 aa  364  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  49.73 
 
 
383 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  49.87 
 
 
392 aa  363  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  48.68 
 
 
379 aa  362  6e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  45.62 
 
 
377 aa  362  6e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  45.62 
 
 
377 aa  362  6e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  51.05 
 
 
391 aa  361  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  46.92 
 
 
381 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  45.36 
 
 
377 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  45.62 
 
 
377 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  45.36 
 
 
377 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  45.36 
 
 
377 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  45.36 
 
 
377 aa  359  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  45.36 
 
 
377 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  50.14 
 
 
387 aa  358  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  45.36 
 
 
377 aa  358  7e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.77 
 
 
402 aa  357  9.999999999999999e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  51.05 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  45.36 
 
 
377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  46.44 
 
 
380 aa  356  2.9999999999999997e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  45.77 
 
 
398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  47.26 
 
 
380 aa  355  8.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  45.62 
 
 
377 aa  354  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  45.6 
 
 
401 aa  354  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  46.44 
 
 
378 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  47.09 
 
 
378 aa  352  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  45.93 
 
 
380 aa  352  8e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  46.56 
 
 
379 aa  351  1e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  48.28 
 
 
387 aa  350  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  47.37 
 
 
378 aa  349  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  46.84 
 
 
373 aa  349  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  50.66 
 
 
383 aa  348  7e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  48.94 
 
 
383 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  48.21 
 
 
393 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  46.42 
 
 
386 aa  347  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  48.15 
 
 
383 aa  345  5e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  48.16 
 
 
394 aa  345  7e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  44.76 
 
 
384 aa  345  7e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  45.91 
 
 
378 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 
381 aa  344  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  46.93 
 
 
380 aa  344  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  44.5 
 
 
384 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 
380 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  46.2 
 
 
388 aa  342  8e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  43.27 
 
 
380 aa  342  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  43.27 
 
 
380 aa  342  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  47.61 
 
 
426 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  47.24 
 
 
387 aa  341  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  46.17 
 
 
393 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  46.17 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  46.17 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  50.53 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>