More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6707 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  100 
 
 
390 aa  799    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  70.34 
 
 
390 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  69.82 
 
 
390 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  69.29 
 
 
390 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  70.26 
 
 
388 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  65.61 
 
 
397 aa  502  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  63.09 
 
 
394 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  62.96 
 
 
383 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  63.09 
 
 
394 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  62.89 
 
 
392 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  61.01 
 
 
379 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  62.7 
 
 
383 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  60.37 
 
 
387 aa  475  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  63.49 
 
 
390 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.57 
 
 
387 aa  472  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  63.32 
 
 
391 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  59.47 
 
 
381 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  59.26 
 
 
377 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  57.82 
 
 
381 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  57.82 
 
 
398 aa  455  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  57.52 
 
 
402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  57.71 
 
 
378 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  58.31 
 
 
394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  57.75 
 
 
401 aa  451  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  54.38 
 
 
379 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  55.7 
 
 
379 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  54.76 
 
 
380 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  55.35 
 
 
386 aa  432  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  53.97 
 
 
380 aa  431  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  54.97 
 
 
386 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  54.76 
 
 
383 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  54.79 
 
 
378 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  56.08 
 
 
381 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  57.26 
 
 
383 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  54.01 
 
 
378 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  56.17 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  52.41 
 
 
377 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  55.53 
 
 
390 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  55.38 
 
 
390 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  54.92 
 
 
392 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  51.87 
 
 
377 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  51.6 
 
 
377 aa  408  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  55.47 
 
 
389 aa  408  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  51.87 
 
 
377 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  51.87 
 
 
377 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  52.93 
 
 
378 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  51.87 
 
 
377 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  56.2 
 
 
388 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  54.92 
 
 
392 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  51.6 
 
 
377 aa  408  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  54.92 
 
 
392 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  51.6 
 
 
377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  56.43 
 
 
379 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  51.6 
 
 
377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  51.6 
 
 
377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  54.59 
 
 
390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  56.2 
 
 
381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  55.08 
 
 
377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  54.48 
 
 
387 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  52.14 
 
 
377 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  52.94 
 
 
380 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  53.97 
 
 
390 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  53.28 
 
 
389 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  52.42 
 
 
400 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  54.59 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  54.57 
 
 
383 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  52.49 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  49.74 
 
 
385 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  51.33 
 
 
380 aa  395  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  54.31 
 
 
383 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  55.41 
 
 
384 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  55.26 
 
 
387 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  46.17 
 
 
386 aa  388  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 
384 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  54.23 
 
 
383 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  51.34 
 
 
382 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  51.6 
 
 
377 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  52.66 
 
 
387 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  55.41 
 
 
381 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  51.34 
 
 
378 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  51.6 
 
 
378 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  51.19 
 
 
379 aa  386  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  52.14 
 
 
386 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  48 
 
 
380 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  51.83 
 
 
394 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  50.27 
 
 
380 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  48 
 
 
380 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  48.4 
 
 
384 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  48.13 
 
 
384 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  47.87 
 
 
381 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77247  cystathionine gamma-lyase  48.98 
 
 
398 aa  380  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.836734  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  55.26 
 
 
383 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  52.22 
 
 
426 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  51.06 
 
 
381 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  52.22 
 
 
426 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  46.7 
 
 
381 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  48.4 
 
 
378 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  52.22 
 
 
426 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  53.06 
 
 
393 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  54.89 
 
 
387 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>