More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1914 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
400 aa  803    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  98.02 
 
 
405 aa  789    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  79.95 
 
 
405 aa  625  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  78.45 
 
 
411 aa  598  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  64.66 
 
 
388 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  62.5 
 
 
387 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  64.44 
 
 
386 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  62.5 
 
 
393 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  62.24 
 
 
393 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.98 
 
 
387 aa  482  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.98 
 
 
387 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  62.24 
 
 
387 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  61.98 
 
 
393 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  62.2 
 
 
389 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  62.24 
 
 
387 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.83 
 
 
386 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  61.78 
 
 
386 aa  475  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  62.24 
 
 
393 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  62.83 
 
 
390 aa  474  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.42 
 
 
388 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2747  cystathionine gamma-synthase  56.96 
 
 
388 aa  455  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002306  cystathionine gamma-synthase  56.5 
 
 
387 aa  454  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00049  cystathionine gamma-synthase  56.23 
 
 
386 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  56.17 
 
 
388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  57.3 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  57.57 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  57.84 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  57.75 
 
 
386 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  58.02 
 
 
386 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  57.75 
 
 
386 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  58.02 
 
 
386 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  57.75 
 
 
386 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.84 
 
 
386 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  57.75 
 
 
386 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  57.75 
 
 
386 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  58.02 
 
 
386 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  58.02 
 
 
386 aa  443  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.88 
 
 
387 aa  444  1e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  58.11 
 
 
388 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  57.75 
 
 
386 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  57.75 
 
 
386 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  57.49 
 
 
386 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  57.75 
 
 
386 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  57.75 
 
 
386 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  58.11 
 
 
413 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  58.38 
 
 
386 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  57.84 
 
 
386 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.3 
 
 
386 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.32 
 
 
385 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  58.38 
 
 
386 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  57.07 
 
 
390 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.03 
 
 
394 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.65 
 
 
385 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.05 
 
 
422 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.05 
 
 
388 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.49 
 
 
385 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.73 
 
 
386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  56.8 
 
 
426 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  57.07 
 
 
426 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  56.53 
 
 
426 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  52.57 
 
 
386 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  50.27 
 
 
382 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 
378 aa  363  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  54.21 
 
 
426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2620  cystathionine gamma-synthase  49.46 
 
 
382 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  47.61 
 
 
383 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  49.21 
 
 
388 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  49.21 
 
 
390 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  50.4 
 
 
394 aa  351  1e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  49.21 
 
 
390 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  48.94 
 
 
390 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  47.33 
 
 
378 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  48.39 
 
 
379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  46.97 
 
 
387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  48.1 
 
 
394 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  46.44 
 
 
387 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  46.51 
 
 
390 aa  332  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  46.7 
 
 
401 aa  332  6e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  46.52 
 
 
384 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  47.59 
 
 
394 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  44.79 
 
 
387 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  47.31 
 
 
392 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  47.63 
 
 
386 aa  330  3e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  48.4 
 
 
393 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  47.98 
 
 
381 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  46.9 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  45.77 
 
 
380 aa  328  9e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  47.8 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  47.59 
 
 
397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  46.54 
 
 
379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  46.67 
 
 
381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  47.61 
 
 
390 aa  326  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  45.79 
 
 
381 aa  326  6e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.76 
 
 
402 aa  325  6e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  47.44 
 
 
389 aa  325  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  46.51 
 
 
398 aa  325  9e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  45.24 
 
 
380 aa  323  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  46.92 
 
 
378 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  46.28 
 
 
379 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  45.83 
 
 
388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>