More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4786 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  88.6 
 
 		 386 aa  686    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  85.12 
 
 		 386 aa  679    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  85.38 
 
 		 386 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  83.81 
 
 		 386 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  85.38 
 
 		 386 aa  681    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  83.81 
 
 		 386 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  85.12 
 
 		 386 aa  678    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  85.49 
 
 		 386 aa  681    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  84.97 
 
 		 386 aa  678    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  89.12 
 
 		 386 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  85.12 
 
 		 386 aa  679    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  85.75 
 
 		 425 aa  685    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  84.86 
 
 		 386 aa  676    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  83.55 
 
 		 386 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 386 aa  788    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  83.81 
 
 		 386 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  85.38 
 
 		 386 aa  681    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  88.86 
 
 		 413 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  84.64 
 
 		 386 aa  680    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  84.72 
 
 		 386 aa  666    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  85.12 
 
 		 386 aa  679    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  85.12 
 
 		 386 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  83.81 
 
 		 386 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  78.07 
 
 		 387 aa  613  9.999999999999999e-175  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2747  cystathionine gamma-synthase  61.78 
 
 		 388 aa  497  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00049  cystathionine gamma-synthase  59.01 
 
 		 386 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002306  cystathionine gamma-synthase  57.66 
 
 		 387 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  61.52 
 
 		 386 aa  482  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.1 
 
 		 390 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  61.78 
 
 		 393 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  61.78 
 
 		 393 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  60.16 
 
 		 388 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.15 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  61.26 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.73 
 
 		 387 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.21 
 
 		 387 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.21 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  61.07 
 
 		 386 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.21 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  60.63 
 
 		 386 aa  474  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.21 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.26 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.95 
 
 		 388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  61.26 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  58.65 
 
 		 388 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  58.38 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  59.26 
 
 		 405 aa  448  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  59.95 
 
 		 411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  58.11 
 
 		 405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  59.42 
 
 		 385 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.94 
 
 		 394 aa  435  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.71 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  60.37 
 
 		 386 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  57.78 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  56.48 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  57.26 
 
 		 388 aa  411  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  55.41 
 
 		 385 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  49.07 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  46.72 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  46.26 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  49.74 
 
 		 426 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  49.74 
 
 		 426 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  46.79 
 
 		 378 aa  351  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  45.53 
 
 		 379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2620  cystathionine gamma-synthase  46.21 
 
 		 382 aa  335  5e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  45.87 
 
 		 380 aa  332  5e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  46.4 
 
 		 378 aa  332  7.000000000000001e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  46.42 
 
 		 394 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  46.15 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  47.75 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  46.13 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.85 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  45.62 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  47.89 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  45.91 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  43.77 
 
 		 384 aa  325  7e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  45.07 
 
 		 377 aa  324  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  44.71 
 
 		 390 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  43.77 
 
 		 388 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  44.83 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  43.88 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  44.56 
 
 		 398 aa  322  5e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  44.56 
 
 		 390 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  44.71 
 
 		 387 aa  322  8e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  44.3 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  43.35 
 
 		 381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  44.85 
 
 		 379 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  43.62 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  43.57 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.03 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  44.88 
 
 		 379 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  44.3 
 
 		 394 aa  318  9e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  44.26 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  43.85 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  45.12 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  44.41 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  46.3 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  42.48 
 
 		 385 aa  316  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 		 389 aa  316  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>