More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0390 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0390  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
364 aa  744    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4336  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 
370 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4158  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 
370 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3997  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 
370 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4007  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 
370 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4480  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 
370 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4276  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 
370 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4389  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 
370 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0801  cystathionine gamma-synthase  50.42 
 
 
367 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2985  cystathionine gamma-synthase  49.44 
 
 
370 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0864  cystathionine gamma-synthase  49.72 
 
 
370 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1667  cystathionine gamma-synthase  50.7 
 
 
367 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4370  cystathionine gamma-synthase  49.72 
 
 
370 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1345  cystathionine gamma-synthase  48.63 
 
 
369 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.496968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4110  cystathionine gamma-synthase  48.61 
 
 
370 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  47.47 
 
 
388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  47.06 
 
 
376 aa  332  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  44.15 
 
 
378 aa  324  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0407  cystathionine gamma-synthase  45.53 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0417  cystathionine gamma-synthase  45.53 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  42.71 
 
 
384 aa  319  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0037  trans-sulfuration enzyme family protein  45.66 
 
 
367 aa  317  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  42.97 
 
 
386 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1805  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  45.18 
 
 
369 aa  317  1e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.63 
 
 
386 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  43.7 
 
 
386 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  43.09 
 
 
386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  44.15 
 
 
377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  43.97 
 
 
425 aa  312  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  41.87 
 
 
383 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  43.97 
 
 
386 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  42.13 
 
 
378 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  43.7 
 
 
386 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  43.7 
 
 
386 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  43.35 
 
 
380 aa  310  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  42.71 
 
 
378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.7 
 
 
386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  43.7 
 
 
386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  43.7 
 
 
386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  43.7 
 
 
386 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  43.7 
 
 
386 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  43.7 
 
 
386 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  43.16 
 
 
386 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  43.7 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  42.9 
 
 
386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  41.33 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  42.9 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  42.9 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  43.62 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  42.9 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.63 
 
 
386 aa  306  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  43.35 
 
 
413 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  43.09 
 
 
386 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  42.02 
 
 
377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  42.02 
 
 
377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 
377 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  41.22 
 
 
377 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 
377 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 
377 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 
377 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 
377 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 
377 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  41.95 
 
 
426 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  41.01 
 
 
378 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 
377 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  41.27 
 
 
401 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  42.18 
 
 
380 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  42.18 
 
 
380 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  41.42 
 
 
398 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.53 
 
 
387 aa  299  4e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.16 
 
 
387 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  41.16 
 
 
426 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  41.95 
 
 
380 aa  299  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.16 
 
 
387 aa  299  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  41.42 
 
 
426 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  40.54 
 
 
390 aa  298  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.16 
 
 
387 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.9 
 
 
387 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  43.16 
 
 
386 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.71 
 
 
397 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  40.69 
 
 
377 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.9 
 
 
387 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  41.27 
 
 
383 aa  297  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  41.1 
 
 
386 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  40.81 
 
 
377 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.27 
 
 
387 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  42.44 
 
 
380 aa  296  4e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  42.18 
 
 
392 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  40.94 
 
 
385 aa  296  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  40.31 
 
 
393 aa  296  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  42.43 
 
 
379 aa  295  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 
393 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  41.24 
 
 
379 aa  295  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.42 
 
 
388 aa  295  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.93 
 
 
386 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  42.67 
 
 
386 aa  293  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  40.64 
 
 
384 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  40.27 
 
 
384 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  40.31 
 
 
393 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  40.96 
 
 
394 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>