More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0037 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0037  trans-sulfuration enzyme family protein  100 
 
 
367 aa  756    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0417  cystathionine gamma-synthase  79.23 
 
 
367 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0407  cystathionine gamma-synthase  79.23 
 
 
367 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1667  cystathionine gamma-synthase  52.35 
 
 
367 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1345  cystathionine gamma-synthase  52.76 
 
 
369 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.496968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0801  cystathionine gamma-synthase  51.8 
 
 
367 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3997  cystathionine gamma-synthase  48.35 
 
 
370 aa  371  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2985  cystathionine gamma-synthase  48.9 
 
 
370 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4110  cystathionine gamma-synthase  48.63 
 
 
370 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4336  cystathionine gamma-synthase  48.35 
 
 
370 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4158  cystathionine gamma-synthase  48.08 
 
 
370 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4007  cystathionine gamma-synthase  48.35 
 
 
370 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4480  cystathionine gamma-synthase  48.08 
 
 
370 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4389  cystathionine gamma-synthase  48.35 
 
 
370 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4370  cystathionine gamma-synthase  48.08 
 
 
370 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4276  cystathionine gamma-synthase  48.08 
 
 
370 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0864  cystathionine gamma-synthase  47.8 
 
 
370 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  47.12 
 
 
388 aa  346  5e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  46.54 
 
 
386 aa  339  5e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  46.36 
 
 
377 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  45.7 
 
 
376 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  45.99 
 
 
378 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0698  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  46.46 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00027232  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  45.7 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2218  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.48 
 
 
382 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  44.74 
 
 
383 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1805  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  48.36 
 
 
369 aa  322  5e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  44.24 
 
 
381 aa  322  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2009  Cystathionine gamma-lyase  44.68 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35589e-20 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0390  cystathionine gamma-synthase  45.66 
 
 
364 aa  317  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  42.35 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  43.13 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  42.94 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  42.11 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  42.66 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  43.34 
 
 
378 aa  298  9e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  40.43 
 
 
378 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  43.89 
 
 
380 aa  296  4e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  41.53 
 
 
377 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  41.53 
 
 
377 aa  296  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  41.53 
 
 
377 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  41.53 
 
 
377 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  41.53 
 
 
377 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  41.53 
 
 
377 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  41.19 
 
 
394 aa  295  9e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  41.26 
 
 
377 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  41.26 
 
 
377 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  41.39 
 
 
377 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  41.26 
 
 
377 aa  292  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  41 
 
 
378 aa  292  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  40.33 
 
 
379 aa  292  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  39.84 
 
 
388 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  43.37 
 
 
383 aa  291  8e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  40.98 
 
 
377 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  40.44 
 
 
377 aa  288  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  40.5 
 
 
394 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  39.44 
 
 
380 aa  286  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  40.66 
 
 
397 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  40.71 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  39.72 
 
 
378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  39.73 
 
 
381 aa  283  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  41.6 
 
 
380 aa  282  8.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  40.39 
 
 
387 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  39.67 
 
 
390 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  39.01 
 
 
390 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1990  cystathionine beta-lyase  39.95 
 
 
383 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.916692  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  39.01 
 
 
390 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  38.74 
 
 
390 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  40.48 
 
 
379 aa  280  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  39.84 
 
 
379 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  42.11 
 
 
390 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  41.44 
 
 
387 aa  279  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  38.33 
 
 
377 aa  279  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.88 
 
 
387 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  40.17 
 
 
381 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  39.83 
 
 
387 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  39.01 
 
 
381 aa  277  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  38.67 
 
 
379 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  39.04 
 
 
378 aa  276  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  38.73 
 
 
379 aa  276  5e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  39.83 
 
 
387 aa  275  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  39 
 
 
392 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  39.83 
 
 
387 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  39.83 
 
 
387 aa  275  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  39.83 
 
 
387 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  39.83 
 
 
387 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  40.4 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.94 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1804  cystathionine beta-lyase  41.05 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.699729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  39 
 
 
387 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  39.83 
 
 
377 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  39.15 
 
 
378 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  40.66 
 
 
392 aa  272  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  38.36 
 
 
380 aa  272  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  38.36 
 
 
380 aa  272  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  38.46 
 
 
381 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  39.17 
 
 
387 aa  271  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  39.34 
 
 
390 aa  271  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  38.72 
 
 
387 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  40 
 
 
387 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>