More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4124 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  98.47 
 
 		 393 aa  803    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  92.56 
 
 		 390 aa  756    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 393 aa  813    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  98.73 
 
 		 393 aa  805    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  50.52 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  48.72 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  49.47 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  47 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  47.52 
 
 		 387 aa  381  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  48.68 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  48.42 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  48.4 
 
 		 377 aa  371  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  49.22 
 
 		 390 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  48.15 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  47.61 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  46.7 
 
 		 381 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  48.58 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  44.71 
 
 		 383 aa  359  4e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  47.35 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  46.95 
 
 		 378 aa  355  7.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  46.61 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  46.49 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  45.04 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  47.06 
 
 		 386 aa  353  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  46.35 
 
 		 390 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  46.35 
 
 		 390 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  46.75 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  46.88 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  44.56 
 
 		 381 aa  346  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  44.71 
 
 		 383 aa  345  6e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  46.35 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  44.97 
 
 		 379 aa  342  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  43.92 
 
 		 379 aa  342  8e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  45.36 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2601  Cystathionine gamma-synthase  43.85 
 
 		 390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  43.58 
 
 		 377 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  44.03 
 
 		 383 aa  334  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  44.3 
 
 		 378 aa  332  6e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 		 390 aa  332  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  45.81 
 
 		 426 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  42.89 
 
 		 386 aa  330  4e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  41.32 
 
 		 380 aa  328  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  43.83 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 		 380 aa  327  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  43.32 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  46.17 
 
 		 383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  44.27 
 
 		 394 aa  325  8.000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  43.05 
 
 		 377 aa  325  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  46.09 
 
 		 387 aa  325  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  43.05 
 
 		 377 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  43.05 
 
 		 377 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  44.53 
 
 		 382 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  43.05 
 
 		 377 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 		 380 aa  324  1e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  43.05 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  43.05 
 
 		 377 aa  323  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  43.54 
 
 		 380 aa  324  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  42.18 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  41.98 
 
 		 378 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 377 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  46.03 
 
 		 388 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  41.6 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 377 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 377 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 377 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  42.33 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  46.46 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  43.12 
 
 		 386 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0667  Cystathionine gamma-synthase  45.53 
 
 		 381 aa  319  5e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  42.45 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  44.92 
 
 		 387 aa  319  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  44.63 
 
 		 387 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  44.68 
 
 		 378 aa  318  9e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  43.98 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  44.07 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  44.35 
 
 		 387 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  44.35 
 
 		 387 aa  316  6e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  44.35 
 
 		 387 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  44.35 
 
 		 387 aa  315  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  44.35 
 
 		 387 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.59 
 
 		 402 aa  315  7e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  41.95 
 
 		 381 aa  315  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  44.07 
 
 		 387 aa  315  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  44.21 
 
 		 392 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  44.21 
 
 		 392 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  44.21 
 
 		 392 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  44.07 
 
 		 387 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  45 
 
 		 389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  44.94 
 
 		 381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  43.04 
 
 		 392 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  41.58 
 
 		 387 aa  311  9e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  43.64 
 
 		 384 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  42.74 
 
 		 376 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  43.48 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  43.65 
 
 		 390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  41.99 
 
 		 379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  42.11 
 
 		 387 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  44.68 
 
 		 379 aa  308  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  40.2 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>