More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0667 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0667  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 381 aa  778    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  79.37 
 
 		 378 aa  632  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  77.11 
 
 		 400 aa  624  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  71.62 
 
 		 380 aa  565  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  74.93 
 
 		 383 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  59.26 
 
 		 378 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  52.52 
 
 		 390 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  52.52 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  52.79 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  51.45 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  51.86 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  49.34 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  52.38 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  54.66 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  49.74 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  51.99 
 
 		 381 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  51.04 
 
 		 386 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  51.58 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  51.84 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  51.84 
 
 		 383 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  49.34 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  48.55 
 
 		 379 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  51.46 
 
 		 381 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  51.19 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  48.15 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  48.54 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  48.14 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.75 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  47.62 
 
 		 379 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  48.41 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  48.67 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  48.94 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  50.53 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  51.32 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  51.47 
 
 		 390 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  48.42 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  50.53 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  50.53 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  46.3 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  46.3 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.68 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  50.53 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  50.4 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  46.3 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  49.74 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  45.77 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  46.3 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  48.95 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  46.3 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  46.03 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  46.03 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  48.03 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  46.03 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  46.15 
 
 		 378 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  46.03 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  45.58 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  46.17 
 
 		 380 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  46.03 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  47.88 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 392 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  50.14 
 
 		 387 aa  362  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  49.6 
 
 		 393 aa  361  9e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  48.81 
 
 		 390 aa  361  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  48 
 
 		 380 aa  358  7e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  49.18 
 
 		 383 aa  357  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  48.64 
 
 		 390 aa  357  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  48.79 
 
 		 377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  48.02 
 
 		 426 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.28 
 
 		 377 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  48.02 
 
 		 381 aa  355  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  47.48 
 
 		 379 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  48.53 
 
 		 378 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  46.65 
 
 		 381 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  48.14 
 
 		 378 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  48.94 
 
 		 387 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  47.62 
 
 		 383 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 		 383 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  47.76 
 
 		 426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  48.54 
 
 		 379 aa  352  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  51.05 
 
 		 385 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  47.76 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  48.82 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  45.38 
 
 		 385 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  49.08 
 
 		 391 aa  349  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  46.05 
 
 		 393 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  49.6 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  46.05 
 
 		 393 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  44.09 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  44.09 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  47.35 
 
 		 378 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  50.79 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 381 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  45.5 
 
 		 387 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  44.88 
 
 		 394 aa  346  4e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  49.08 
 
 		 372 aa  346  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  44.88 
 
 		 394 aa  345  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  47.16 
 
 		 393 aa  345  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>