More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3411 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 395 aa  808    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1948  Cystathionine gamma-synthase  58.52 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285374 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33390  cystathione gamma synthase  52.79 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0131523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  52.96 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  41.27 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  40.72 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  43.9 
 
 		 374 aa  302  6.000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  42.49 
 
 		 378 aa  302  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  42.27 
 
 		 394 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  39.39 
 
 		 392 aa  299  5e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  44.85 
 
 		 386 aa  299  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  39.95 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  41.77 
 
 		 388 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  42.93 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  42.49 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.47 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  41.3 
 
 		 393 aa  293  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  44.53 
 
 		 391 aa  292  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  42.24 
 
 		 390 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.97 
 
 		 386 aa  292  6e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  40.66 
 
 		 401 aa  292  7e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  42.24 
 
 		 390 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  39.85 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.19 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  42.82 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.53 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  41.98 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.47 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 		 423 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  40.77 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  42.12 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  40.46 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  42.64 
 
 		 383 aa  289  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  41.37 
 
 		 400 aa  289  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  42.45 
 
 		 377 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  40.71 
 
 		 390 aa  289  7e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 		 423 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  41.19 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.81 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  40.97 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  41.41 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  41.92 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  40.77 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  41.56 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  40.84 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  40.84 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.27 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  40.82 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  40.62 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  40.15 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  41.21 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  42.93 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  42.27 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  43.51 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  42.5 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  43.26 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  41.56 
 
 		 398 aa  283  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  41.3 
 
 		 397 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  40 
 
 		 393 aa  282  6.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  40.36 
 
 		 397 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  41.43 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  40.93 
 
 		 378 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  40.94 
 
 		 377 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.69 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  40.94 
 
 		 377 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  41.04 
 
 		 397 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  44.67 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  41.73 
 
 		 378 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  40.94 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  41.03 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  40.94 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  40.94 
 
 		 377 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  40.94 
 
 		 377 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  40.16 
 
 		 380 aa  280  4e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  41.35 
 
 		 377 aa  279  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  42.78 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  40.82 
 
 		 392 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  41.37 
 
 		 394 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  39.84 
 
 		 397 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  39.33 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  39.33 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  39.44 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  41.86 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  39.84 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  40.68 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  40.68 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  40.46 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  40.68 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  38.78 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  41.49 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.6 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  41.3 
 
 		 401 aa  276  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  41.15 
 
 		 398 aa  275  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.33 
 
 		 393 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4283  cystathionine gamma-synthase  44.08 
 
 		 389 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940043  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  38.68 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  40.78 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>