More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1705 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 413 aa  857    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  66.49 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  66.23 
 
 		 397 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  65.21 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  65.46 
 
 		 397 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  63.64 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  63.38 
 
 		 397 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  63.64 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  63.9 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  62.09 
 
 		 392 aa  521  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  63.38 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  63.99 
 
 		 394 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  62.11 
 
 		 392 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  63.38 
 
 		 391 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  62.72 
 
 		 393 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  60.78 
 
 		 392 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  59.42 
 
 		 390 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  54.78 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  54.12 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  53.57 
 
 		 392 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  51.66 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  51.68 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  52.19 
 
 		 400 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  51.3 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  48.06 
 
 		 398 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  47.8 
 
 		 398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  46.92 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  47.15 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  49.1 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  48.85 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  50.39 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  48.59 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  48.85 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  48.85 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  50 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  48.34 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  48.34 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  48.85 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  48.85 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  50 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  46.23 
 
 		 418 aa  388  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  47.27 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  45.97 
 
 		 399 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  46.77 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.86 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.86 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  43.9 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  45.06 
 
 		 401 aa  363  3e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  47.49 
 
 		 407 aa  362  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  45.78 
 
 		 398 aa  359  6e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  46.43 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  42.97 
 
 		 390 aa  350  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43 
 
 		 397 aa  348  7e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  47.42 
 
 		 380 aa  348  8e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  44.91 
 
 		 386 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  43.19 
 
 		 401 aa  346  5e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.28 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  43.61 
 
 		 398 aa  342  5e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.86 
 
 		 403 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  43.64 
 
 		 383 aa  339  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.51 
 
 		 396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  43.56 
 
 		 382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  41.56 
 
 		 388 aa  335  7.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  42.75 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.01 
 
 		 403 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.34 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  41.34 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.34 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.67 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  41.94 
 
 		 393 aa  332  6e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.38 
 
 		 402 aa  332  7.000000000000001e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  43.6 
 
 		 377 aa  332  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  43.38 
 
 		 378 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.51 
 
 		 397 aa  332  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  41.39 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.9 
 
 		 378 aa  331  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 377 aa  330  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.97 
 
 		 393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.34 
 
 		 403 aa  329  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 377 aa  328  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  43.34 
 
 		 377 aa  328  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.82 
 
 		 394 aa  329  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.22 
 
 		 392 aa  328  7e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  42.97 
 
 		 379 aa  328  9e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.64 
 
 		 403 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2823  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  42.15 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561199  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1086  cystathionine gamma-synthase  40.97 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  41.6 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  42.39 
 
 		 391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  41.73 
 
 		 390 aa  326  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  41.18 
 
 		 392 aa  326  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.68 
 
 		 399 aa  325  6e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0610  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.86 
 
 		 439 aa  325  8.000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.106218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>