More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1860 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
393 aa  808    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43850  Cystathionine gamma-synthase  56.04 
 
 
396 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  46.91 
 
 
394 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  46.72 
 
 
393 aa  362  9e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  45.29 
 
 
392 aa  354  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  45.57 
 
 
401 aa  352  4e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  45.24 
 
 
390 aa  353  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  45.2 
 
 
399 aa  353  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  45.97 
 
 
397 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  48.91 
 
 
394 aa  349  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  46.51 
 
 
392 aa  348  8e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  47.53 
 
 
397 aa  346  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  45.6 
 
 
397 aa  346  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  45.08 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  43.69 
 
 
394 aa  340  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  44.29 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  43.81 
 
 
397 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  43.48 
 
 
390 aa  338  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  44.33 
 
 
391 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  43.81 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  44.82 
 
 
378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  44.59 
 
 
397 aa  336  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  43.56 
 
 
397 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  43.56 
 
 
397 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  45.9 
 
 
380 aa  332  5e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  43.04 
 
 
391 aa  332  6e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  46.15 
 
 
390 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  43.11 
 
 
382 aa  330  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  40 
 
 
408 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  42.67 
 
 
378 aa  328  9e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  44.86 
 
 
407 aa  325  7e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  43.15 
 
 
386 aa  325  9e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  45.88 
 
 
392 aa  324  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1004  cystathionine gamma-synthase  43.51 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  hitchhiker  0.000527266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  42.16 
 
 
383 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  44.39 
 
 
380 aa  320  3e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  44.1 
 
 
393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  44.36 
 
 
377 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  41.94 
 
 
413 aa  318  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3306  Cystathionine gamma-lyase  41.76 
 
 
391 aa  318  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  40.15 
 
 
390 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  39.9 
 
 
390 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  43.33 
 
 
392 aa  316  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  43.51 
 
 
383 aa  316  5e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  44.05 
 
 
392 aa  316  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  42.16 
 
 
378 aa  315  7e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  40.05 
 
 
398 aa  315  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  42.46 
 
 
380 aa  315  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  42.86 
 
 
386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  39.39 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3858  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.94 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  41.48 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3131  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.94 
 
 
441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  41.64 
 
 
388 aa  312  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  42.11 
 
 
386 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  39.44 
 
 
388 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  41.94 
 
 
392 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  41.65 
 
 
389 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  41.27 
 
 
379 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40.72 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  42.42 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  40.71 
 
 
383 aa  309  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  41.14 
 
 
400 aa  308  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  43.84 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  43.84 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  40.46 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  43.84 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  43.84 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  43.84 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  43.84 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.79 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  42.62 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  43.84 
 
 
377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  40.51 
 
 
426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  41.26 
 
 
378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  43.26 
 
 
377 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1289  Cystathionine gamma-lyase  40 
 
 
388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.985724  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  43.56 
 
 
377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1237  cystathionine gamma-synthase  40.15 
 
 
398 aa  306  5.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  41.98 
 
 
394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  40.83 
 
 
376 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  43.56 
 
 
377 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  40.15 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  40.41 
 
 
377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.06 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.06 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  40.2 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  40 
 
 
426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  42.74 
 
 
377 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  41.19 
 
 
392 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40 
 
 
393 aa  302  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  40.82 
 
 
387 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  40.71 
 
 
379 aa  302  8.000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  44.35 
 
 
390 aa  301  9e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  38.42 
 
 
398 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  39.54 
 
 
397 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  38.21 
 
 
381 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  41.75 
 
 
400 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  37.97 
 
 
398 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  39.59 
 
 
426 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>