More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43850 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_43850  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
396 aa  794    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  56.04 
 
 
393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  49.35 
 
 
390 aa  339  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1004  cystathionine gamma-synthase  47.94 
 
 
394 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  hitchhiker  0.000527266 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  42.78 
 
 
393 aa  319  5e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1289  Cystathionine gamma-lyase  46.7 
 
 
388 aa  315  7e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.985724  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  44.64 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  44.36 
 
 
397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  40.86 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  44.36 
 
 
397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  44.1 
 
 
397 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  44.36 
 
 
397 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  43.85 
 
 
397 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  44.19 
 
 
378 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  43.67 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  44.53 
 
 
397 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.9 
 
 
397 aa  309  6.999999999999999e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  44.08 
 
 
397 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  42.01 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  46.82 
 
 
389 aa  306  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  42.71 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  43.19 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  43.51 
 
 
397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  44.85 
 
 
382 aa  301  9e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  42.53 
 
 
378 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  42.09 
 
 
392 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  44.96 
 
 
378 aa  300  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  44.53 
 
 
391 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.71 
 
 
404 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.71 
 
 
404 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  45.64 
 
 
387 aa  299  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  45.04 
 
 
426 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.87 
 
 
399 aa  298  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  41.21 
 
 
385 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  43.04 
 
 
392 aa  297  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.24 
 
 
402 aa  296  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  43.96 
 
 
394 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  44.96 
 
 
386 aa  296  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  45.04 
 
 
426 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  41.54 
 
 
399 aa  295  8e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  42.36 
 
 
407 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  43.41 
 
 
378 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.73 
 
 
389 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  43.56 
 
 
380 aa  294  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  44.8 
 
 
408 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  40.83 
 
 
392 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  44.65 
 
 
388 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.81 
 
 
393 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  42.53 
 
 
377 aa  292  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  43.51 
 
 
377 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  45.2 
 
 
383 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  41.75 
 
 
391 aa  290  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.49 
 
 
397 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1981  cystathionine gamma-synthase  43.08 
 
 
400 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  43.04 
 
 
400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  41.39 
 
 
379 aa  288  8e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  43.8 
 
 
398 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  44.62 
 
 
378 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.36 
 
 
396 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  44.42 
 
 
426 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  42.64 
 
 
390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1237  cystathionine gamma-synthase  39.23 
 
 
398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  41.67 
 
 
395 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  45.36 
 
 
388 aa  286  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  44.67 
 
 
394 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  40.05 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.71 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.41 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  44.73 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.5 
 
 
406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  44.42 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  41.9 
 
 
393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  41.9 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  44.62 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  44.64 
 
 
426 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.08 
 
 
383 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  43.59 
 
 
390 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  43.42 
 
 
381 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.08 
 
 
403 aa  282  9e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.86 
 
 
386 aa  282  9e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  43.56 
 
 
392 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  43.56 
 
 
392 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  43.56 
 
 
392 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  43.96 
 
 
397 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.13 
 
 
394 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  44.25 
 
 
392 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  43.59 
 
 
390 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  41.28 
 
 
400 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  43.85 
 
 
390 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  39.38 
 
 
378 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.77 
 
 
403 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  40.83 
 
 
383 aa  279  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3858  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.25 
 
 
441 aa  279  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.5 
 
 
397 aa  278  8e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  43.81 
 
 
393 aa  278  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3306  Cystathionine gamma-lyase  40.22 
 
 
391 aa  278  9e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  37.69 
 
 
392 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.27 
 
 
402 aa  278  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.59 
 
 
395 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  42.67 
 
 
399 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>