More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1237 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1237  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
398 aa  814    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  40.15 
 
 
393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1289  Cystathionine gamma-lyase  39.46 
 
 
388 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.985724  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.76 
 
 
378 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  41.16 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1212  Cystathionine gamma-synthase  37.8 
 
 
403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  36.67 
 
 
399 aa  272  8.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.56 
 
 
394 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.21 
 
 
387 aa  269  8e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  41.03 
 
 
392 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43850  Cystathionine gamma-synthase  39.23 
 
 
396 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  40.58 
 
 
392 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  38.59 
 
 
386 aa  267  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  37.14 
 
 
383 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  38.42 
 
 
392 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  39.19 
 
 
393 aa  266  4e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  38.14 
 
 
394 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.24 
 
 
403 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1004  cystathionine gamma-synthase  37.57 
 
 
394 aa  265  8.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  hitchhiker  0.000527266 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  38.99 
 
 
391 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1364  cystathionine gamma-synthase  36.96 
 
 
385 aa  265  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00282102  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  40.66 
 
 
390 aa  264  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.24 
 
 
403 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2286  cystathionine gamma-synthase  37.87 
 
 
396 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0318668  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  36.15 
 
 
426 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.55 
 
 
397 aa  262  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.03 
 
 
401 aa  261  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  36.06 
 
 
386 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  35.9 
 
 
426 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.83 
 
 
403 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  40.71 
 
 
376 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  38.71 
 
 
386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.52 
 
 
403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.24 
 
 
403 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  40.87 
 
 
392 aa  258  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.12 
 
 
397 aa  258  9e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  41.81 
 
 
400 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  36.1 
 
 
378 aa  258  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.66 
 
 
403 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.66 
 
 
403 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  37.2 
 
 
390 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1264  cystathionine gamma-synthase  37.5 
 
 
393 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.24 
 
 
403 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  36.36 
 
 
377 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  35.13 
 
 
426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  40.87 
 
 
386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  38.71 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  39.13 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  39.53 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  36.15 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  38.84 
 
 
397 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  36.66 
 
 
388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.81 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  36.92 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  37.5 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  37.23 
 
 
391 aa  253  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  40.33 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  36.32 
 
 
426 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.08 
 
 
393 aa  252  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  37.73 
 
 
402 aa  252  8.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  39.13 
 
 
397 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  42.03 
 
 
392 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  39.18 
 
 
398 aa  251  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.66 
 
 
403 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  39.23 
 
 
381 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  36.69 
 
 
380 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  38.44 
 
 
379 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  36.29 
 
 
392 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3306  Cystathionine gamma-lyase  35.08 
 
 
391 aa  250  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  39.13 
 
 
397 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  38.12 
 
 
380 aa  249  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.94 
 
 
386 aa  250  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  38.3 
 
 
408 aa  250  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  35.98 
 
 
386 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.3 
 
 
387 aa  249  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  38.32 
 
 
382 aa  249  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  39.01 
 
 
388 aa  249  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  38.53 
 
 
378 aa  249  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  39.13 
 
 
397 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  37.44 
 
 
393 aa  249  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.75 
 
 
404 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.75 
 
 
404 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.47 
 
 
403 aa  249  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.32 
 
 
394 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  37.63 
 
 
391 aa  249  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  39.65 
 
 
381 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.97 
 
 
407 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.66 
 
 
394 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  35.75 
 
 
385 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.69 
 
 
387 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.03 
 
 
396 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  38.55 
 
 
397 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  39.71 
 
 
378 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  36.27 
 
 
377 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  36.27 
 
 
377 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  36.27 
 
 
377 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  39.83 
 
 
407 aa  247  3e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  36.27 
 
 
377 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.87 
 
 
397 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.36 
 
 
388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>