More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09046 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  100 
 
 		 390 aa  805    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  45.36 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  44.39 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  43.32 
 
 		 394 aa  318  9e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  44.21 
 
 		 392 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  41.91 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  41.6 
 
 		 378 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 377 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  41.18 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  42.16 
 
 		 397 aa  306  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  38.68 
 
 		 388 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  41.33 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.82 
 
 		 386 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  41.73 
 
 		 394 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  40.66 
 
 		 397 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  40.66 
 
 		 397 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  44.35 
 
 		 393 aa  301  9e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  41.55 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  40.05 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  39.79 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  41.87 
 
 		 394 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  41.21 
 
 		 394 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  42.13 
 
 		 391 aa  298  8e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  41.22 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  39.27 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  39.79 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  40.37 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  42.06 
 
 		 400 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  41.75 
 
 		 397 aa  297  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  40.72 
 
 		 397 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  40.31 
 
 		 400 aa  295  9e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  40.72 
 
 		 397 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  41.48 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  40.45 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  40.8 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  38.76 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  39.22 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  40.32 
 
 		 398 aa  292  7e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  40.52 
 
 		 392 aa  292  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.53 
 
 		 387 aa  291  9e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  40.11 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  41.8 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  41.02 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  41.02 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  41.02 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.06 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  40.21 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  42.38 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  39.26 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  41.02 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  40.27 
 
 		 388 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  41.02 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  41.02 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  43.08 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  41.02 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  40.68 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  40.75 
 
 		 377 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  38.8 
 
 		 394 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  41.64 
 
 		 383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  39.74 
 
 		 383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  39.68 
 
 		 377 aa  289  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  40.71 
 
 		 395 aa  289  7e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  41.11 
 
 		 397 aa  289  7e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  40.75 
 
 		 377 aa  288  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  41.02 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  39.13 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  43.01 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  41.05 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  39.85 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  42.55 
 
 		 393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.28 
 
 		 393 aa  285  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  40.24 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  39.52 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  39.52 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4838  cystathionine gamma-synthase  40.53 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.370286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4283  cystathionine gamma-synthase  39.94 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940043  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  42.58 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  36.69 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  38.05 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  41.51 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  38.89 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  38.73 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  38.62 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0416  cystathionine gamma-synthase  42.62 
 
 		 386 aa  282  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.25 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0406  cystathionine gamma-synthase  42.62 
 
 		 386 aa  282  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  38.46 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  38.32 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  38.99 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.84 
 
 		 403 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.81 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  39.58 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.77 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  38.61 
 
 		 388 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  39.73 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.05 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  40.47 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>