More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1212 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1212  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
403 aa  823    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  41.73 
 
 
394 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2537  cystathionine gamma-synthase  42.55 
 
 
410 aa  309  5e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  40.15 
 
 
390 aa  306  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  40.56 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4472  cystathionine gamma-synthase  43.36 
 
 
409 aa  302  7.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00089056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0823  cystathionine gamma-synthase  43.04 
 
 
406 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  hitchhiker  0.000000196482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  38.58 
 
 
393 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  42.47 
 
 
394 aa  295  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  41.62 
 
 
401 aa  290  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  40.74 
 
 
399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  43.24 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  39.74 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  40.1 
 
 
418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  40.5 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  39.54 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  39.39 
 
 
393 aa  281  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  38.9 
 
 
399 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  40.82 
 
 
396 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0500  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.71 
 
 
393 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.960396  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  36.45 
 
 
401 aa  280  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  39.95 
 
 
397 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1851  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.2 
 
 
404 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  40.69 
 
 
426 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  40.26 
 
 
397 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  40 
 
 
397 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  39.7 
 
 
388 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  42.02 
 
 
426 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  39.9 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  39.8 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  39.69 
 
 
397 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  39.55 
 
 
394 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  37.85 
 
 
392 aa  274  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  41.49 
 
 
426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1237  cystathionine gamma-synthase  37.8 
 
 
398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.65 
 
 
403 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.95 
 
 
403 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.9 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  40.75 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  39.65 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1004  cystathionine gamma-synthase  39.85 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  hitchhiker  0.000527266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.38 
 
 
403 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  39.65 
 
 
390 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 
398 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  39.39 
 
 
390 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  39.08 
 
 
379 aa  269  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.66 
 
 
397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.85 
 
 
402 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 
398 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.19 
 
 
403 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  38.68 
 
 
392 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  40.7 
 
 
393 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  37.97 
 
 
397 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  38.23 
 
 
397 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  38.46 
 
 
392 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1730  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.69 
 
 
434 aa  268  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000563319  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  38.23 
 
 
397 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  37.44 
 
 
385 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.22 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  39.49 
 
 
378 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.44 
 
 
403 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  39.85 
 
 
399 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  37.44 
 
 
386 aa  266  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  35.46 
 
 
380 aa  266  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.34 
 
 
395 aa  265  8e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  37.95 
 
 
377 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  38.23 
 
 
397 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  39.07 
 
 
391 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  40.05 
 
 
392 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.19 
 
 
403 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  36.55 
 
 
398 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.19 
 
 
403 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  35.97 
 
 
379 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  40.16 
 
 
398 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  41.71 
 
 
390 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  38.38 
 
 
381 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  38.27 
 
 
378 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  36.84 
 
 
434 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2621  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.41 
 
 
432 aa  263  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.74 
 
 
388 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  40 
 
 
401 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2814  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.59 
 
 
430 aa  263  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  37.95 
 
 
377 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  37.97 
 
 
397 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  39.03 
 
 
381 aa  262  6.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  42.17 
 
 
400 aa  262  6.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.94 
 
 
403 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  37.69 
 
 
377 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  36.48 
 
 
397 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  42.17 
 
 
405 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0243  cystathionine gamma-synthase  39.36 
 
 
383 aa  261  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.814419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  38.42 
 
 
378 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  38.62 
 
 
384 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  39.29 
 
 
377 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.52 
 
 
398 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0819  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.43 
 
 
430 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230918  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  38.52 
 
 
377 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  35.18 
 
 
380 aa  260  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  39.47 
 
 
408 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  38.68 
 
 
390 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>