More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2587 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
390 aa  783    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  56.57 
 
 
408 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  44.29 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  43.62 
 
 
392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  42.08 
 
 
394 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  43.22 
 
 
390 aa  331  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43850  Cystathionine gamma-synthase  49.35 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.23 
 
 
378 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  43.64 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  41.73 
 
 
413 aa  312  7.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  45.45 
 
 
394 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  44.85 
 
 
386 aa  309  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  45.71 
 
 
394 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.75 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.38 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  44.68 
 
 
392 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  44.79 
 
 
394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  42.71 
 
 
418 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  44.41 
 
 
383 aa  305  8.000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  43.56 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  41.86 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  43.15 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.01 
 
 
393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.78 
 
 
389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  41.69 
 
 
383 aa  302  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  41.86 
 
 
378 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.58 
 
 
404 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.58 
 
 
404 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  46.89 
 
 
401 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  43.67 
 
 
400 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  44.39 
 
 
387 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  43.23 
 
 
398 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0066  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.58 
 
 
443 aa  300  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  42.86 
 
 
400 aa  299  5e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.34 
 
 
393 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  42.82 
 
 
397 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  40.77 
 
 
392 aa  298  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  44.44 
 
 
399 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  44.13 
 
 
383 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  44.42 
 
 
398 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  41.35 
 
 
401 aa  297  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  44.07 
 
 
398 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  45.08 
 
 
378 aa  296  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  45.66 
 
 
398 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  40.73 
 
 
392 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  40.46 
 
 
397 aa  296  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  40.51 
 
 
392 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  43.34 
 
 
379 aa  295  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  38.62 
 
 
392 aa  295  7e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  40.51 
 
 
392 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  40.98 
 
 
397 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  41.45 
 
 
401 aa  294  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  43.34 
 
 
381 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 
397 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  41.71 
 
 
377 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  40.87 
 
 
397 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.3 
 
 
394 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  40.21 
 
 
397 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  40.41 
 
 
397 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  40.77 
 
 
391 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  40.77 
 
 
391 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  40.51 
 
 
392 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1757  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  41.61 
 
 
431 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  41.09 
 
 
379 aa  293  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  40.26 
 
 
392 aa  292  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  42.12 
 
 
397 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1309  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.55 
 
 
428 aa  292  7e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0637456  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.04 
 
 
383 aa  292  8e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  43.52 
 
 
392 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  43.52 
 
 
392 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  43.52 
 
 
392 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  40.67 
 
 
400 aa  292  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6243  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.95 
 
 
442 aa  291  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106831  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  43.75 
 
 
397 aa  291  9e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  42.51 
 
 
377 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  40.26 
 
 
392 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  43.68 
 
 
389 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  40.87 
 
 
397 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.01 
 
 
406 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  41.13 
 
 
392 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 
378 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  40 
 
 
391 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  44.19 
 
 
407 aa  290  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3718  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  41.05 
 
 
431 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  40.6 
 
 
397 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  40 
 
 
391 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.03 
 
 
403 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  41.25 
 
 
389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  40.99 
 
 
380 aa  289  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.14 
 
 
394 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  43.34 
 
 
390 aa  288  8e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  40.31 
 
 
385 aa  288  8e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  46.35 
 
 
385 aa  288  9e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  40.98 
 
 
398 aa  288  9e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  39.9 
 
 
378 aa  288  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  43.86 
 
 
381 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  41.71 
 
 
381 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  40.26 
 
 
386 aa  288  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  42.78 
 
 
396 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  43.63 
 
 
378 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>