More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6425 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
385 aa  756    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  76.86 
 
 
392 aa  591  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  70.9 
 
 
387 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  71.88 
 
 
383 aa  537  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  69.47 
 
 
381 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  69.31 
 
 
379 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  68.52 
 
 
379 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  68.85 
 
 
387 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  66.84 
 
 
393 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  70 
 
 
383 aa  511  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  66.32 
 
 
387 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  69.58 
 
 
380 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  66.58 
 
 
390 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  69.31 
 
 
381 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  68.78 
 
 
380 aa  502  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  65 
 
 
389 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  67.4 
 
 
383 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  65.69 
 
 
383 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  66.33 
 
 
411 aa  494  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  66.58 
 
 
388 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  66.67 
 
 
406 aa  481  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  64.19 
 
 
392 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  64.19 
 
 
392 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  66.22 
 
 
384 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  64.19 
 
 
392 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  61.68 
 
 
387 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  61.26 
 
 
389 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  62.53 
 
 
390 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  62.27 
 
 
393 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  59.79 
 
 
377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  63.61 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1055  Cystathionine gamma-synthase  65.98 
 
 
413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  58.64 
 
 
394 aa  440  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  56.17 
 
 
398 aa  423  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  55.91 
 
 
401 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  55.53 
 
 
379 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17590  cystathionine gamma-lyase  60.97 
 
 
419 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  55.64 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  55.03 
 
 
378 aa  415  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  56.1 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  55.41 
 
 
388 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  57.18 
 
 
394 aa  413  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  55.5 
 
 
390 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  55.76 
 
 
390 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  55.76 
 
 
390 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  54.07 
 
 
381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  51.19 
 
 
380 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  53.12 
 
 
386 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  51.58 
 
 
381 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  56.48 
 
 
397 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  52.52 
 
 
378 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  54.52 
 
 
390 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  51.19 
 
 
379 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  54.64 
 
 
377 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  51.99 
 
 
379 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  50.26 
 
 
380 aa  389  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  53.3 
 
 
376 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  50.26 
 
 
387 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  53.3 
 
 
378 aa  383  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  51.45 
 
 
380 aa  378  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  56 
 
 
372 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  47.53 
 
 
385 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  52.24 
 
 
400 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  49.48 
 
 
387 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  52.33 
 
 
392 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  50.79 
 
 
380 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  50.52 
 
 
380 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  48.54 
 
 
377 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  48.28 
 
 
377 aa  371  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  54.92 
 
 
390 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  48.54 
 
 
377 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  52.63 
 
 
394 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  52.89 
 
 
394 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  55.97 
 
 
380 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  53.64 
 
 
386 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  48.01 
 
 
377 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  48.28 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  48.01 
 
 
377 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  48.28 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  48.54 
 
 
377 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  50.26 
 
 
383 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  48.81 
 
 
377 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  48.01 
 
 
377 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  50.79 
 
 
378 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  48.42 
 
 
390 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  46.34 
 
 
392 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  47.48 
 
 
377 aa  363  3e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  52.2 
 
 
391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  51.23 
 
 
390 aa  362  8e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  51.33 
 
 
378 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  51.19 
 
 
383 aa  360  2e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  48.42 
 
 
387 aa  359  5e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  52.48 
 
 
381 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0909  Cystathionine gamma-lyase  55.15 
 
 
359 aa  356  5e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.999946  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 
381 aa  356  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  49.75 
 
 
419 aa  355  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 
373 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  50 
 
 
383 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  48.13 
 
 
382 aa  352  5e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  48.15 
 
 
383 aa  351  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>