More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2737 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 400 aa  821    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  65.15 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  65.8 
 
 		 398 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  66.06 
 
 		 398 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  64.78 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  64.78 
 
 		 398 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  63.57 
 
 		 396 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  61.27 
 
 		 418 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  59.74 
 
 		 394 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  58.51 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  58.06 
 
 		 399 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  55.16 
 
 		 401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  50.78 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  51.43 
 
 		 392 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  52.19 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  49.1 
 
 		 390 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  52.73 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  52.73 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  51.69 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  50.25 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  50.13 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  50.39 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  49.35 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  45.45 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  48.34 
 
 		 391 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 394 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  48.72 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  46.68 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  46.67 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  46.41 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  46.41 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  46.41 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 401 aa  364  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  46.15 
 
 		 392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  44.44 
 
 		 392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  44.85 
 
 		 397 aa  362  6e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  48.06 
 
 		 390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  46.15 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  47.8 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  46.85 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  46.15 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  46.41 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  46.41 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  45.9 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  48.32 
 
 		 392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  46.09 
 
 		 396 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  46.58 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  45.83 
 
 		 398 aa  338  9e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  43.13 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  46.51 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.48 
 
 		 427 aa  333  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1156  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.14 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.3 
 
 		 404 aa  332  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.3 
 
 		 404 aa  332  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  44.87 
 
 		 401 aa  332  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.69 
 
 		 396 aa  331  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.78 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  43.26 
 
 		 379 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  41.18 
 
 		 390 aa  329  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  42.75 
 
 		 386 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  42.49 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  42.75 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  42.6 
 
 		 386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.67 
 
 		 378 aa  326  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.01 
 
 		 393 aa  325  9e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  45.01 
 
 		 391 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  42.64 
 
 		 383 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.19 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.1 
 
 		 403 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2823  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.48 
 
 		 443 aa  323  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561199  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  46.77 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.16 
 
 		 393 aa  322  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.05 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.23 
 
 		 389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.67 
 
 		 391 aa  318  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.32 
 
 		 403 aa  318  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13730  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  40.9 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125718  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  44.22 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  43.01 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  43.12 
 
 		 387 aa  316  4e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.66 
 
 		 406 aa  316  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  42.71 
 
 		 384 aa  316  5e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.41 
 
 		 402 aa  316  5e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.58 
 
 		 383 aa  315  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.41 
 
 		 395 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.12 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.62 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  42.67 
 
 		 380 aa  315  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.05 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.34 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  43.33 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  42.12 
 
 		 381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  43.96 
 
 		 389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  43.08 
 
 		 388 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  43.33 
 
 		 394 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  44.56 
 
 		 383 aa  312  7.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.08 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>