More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1496 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  100 
 
 
390 aa  807    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  63.87 
 
 
391 aa  534  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  61.4 
 
 
388 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  57.84 
 
 
393 aa  505  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  54.52 
 
 
402 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2612  Cystathionine gamma-synthase  55.24 
 
 
395 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1335  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.07 
 
 
389 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.04 
 
 
395 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.92 
 
 
394 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.45 
 
 
397 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.59 
 
 
403 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.51 
 
 
393 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.9 
 
 
392 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.05 
 
 
404 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.9 
 
 
393 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.05 
 
 
404 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.47 
 
 
402 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  46.98 
 
 
392 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.36 
 
 
403 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.1 
 
 
403 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.1 
 
 
403 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.33 
 
 
403 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.7 
 
 
397 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  44.7 
 
 
396 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.85 
 
 
403 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.39 
 
 
403 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.47 
 
 
401 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.07 
 
 
403 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.14 
 
 
406 aa  363  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.73 
 
 
396 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.83 
 
 
394 aa  360  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  43.75 
 
 
394 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.96 
 
 
397 aa  359  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.73 
 
 
399 aa  358  7e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.07 
 
 
403 aa  358  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.15 
 
 
405 aa  358  7e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.39 
 
 
396 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.83 
 
 
411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.41 
 
 
396 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.3 
 
 
403 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.41 
 
 
383 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.82 
 
 
397 aa  355  7.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  44.59 
 
 
402 aa  355  7.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.41 
 
 
396 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.41 
 
 
396 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.41 
 
 
396 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.13 
 
 
396 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  42.75 
 
 
393 aa  353  2e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.47 
 
 
411 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.64 
 
 
423 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.64 
 
 
423 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.9 
 
 
396 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.64 
 
 
405 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.64 
 
 
423 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.64 
 
 
423 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.64 
 
 
396 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.64 
 
 
396 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.89 
 
 
402 aa  350  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.04 
 
 
410 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  44.88 
 
 
414 aa  349  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.67 
 
 
402 aa  349  5e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.38 
 
 
402 aa  349  5e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  42.05 
 
 
401 aa  348  1e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.13 
 
 
402 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  44.41 
 
 
394 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.36 
 
 
407 aa  346  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.07 
 
 
402 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.78 
 
 
412 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.96 
 
 
406 aa  346  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.78 
 
 
410 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.19 
 
 
396 aa  345  8e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.78 
 
 
412 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.78 
 
 
412 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.93 
 
 
397 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  43.41 
 
 
390 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.49 
 
 
407 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.01 
 
 
402 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.56 
 
 
403 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.04 
 
 
404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.44 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.04 
 
 
394 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.67 
 
 
398 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.67 
 
 
401 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.24 
 
 
396 aa  340  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.64 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.84 
 
 
411 aa  340  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.55 
 
 
406 aa  339  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.97 
 
 
407 aa  338  7e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.2 
 
 
394 aa  338  8e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.46 
 
 
397 aa  338  9e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.04 
 
 
394 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.99 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  43.48 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.58 
 
 
391 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1086  cystathionine gamma-synthase  44.62 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.78 
 
 
404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.78 
 
 
404 aa  336  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.16 
 
 
404 aa  335  7e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.56 
 
 
403 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1689  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.93 
 
 
413 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.79324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>