More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1699 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  100 
 
 
402 aa  830    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2612  Cystathionine gamma-synthase  76.96 
 
 
395 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1335  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  58.46 
 
 
391 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  54.52 
 
 
388 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  54.52 
 
 
390 aa  455  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  58.46 
 
 
393 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.61 
 
 
393 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.04 
 
 
392 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.97 
 
 
395 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.08 
 
 
396 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.77 
 
 
389 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  47.98 
 
 
396 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.58 
 
 
404 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.58 
 
 
404 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  45.55 
 
 
392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.74 
 
 
394 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.45 
 
 
393 aa  358  9e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.13 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.08 
 
 
403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.1 
 
 
397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.06 
 
 
402 aa  356  5e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.06 
 
 
406 aa  353  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.31 
 
 
402 aa  352  5e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.71 
 
 
394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.08 
 
 
403 aa  352  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.9 
 
 
394 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.48 
 
 
410 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.35 
 
 
396 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.84 
 
 
396 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.84 
 
 
396 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.84 
 
 
396 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.08 
 
 
403 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.84 
 
 
396 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.6 
 
 
397 aa  345  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  46.13 
 
 
414 aa  345  8e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.62 
 
 
395 aa  345  8e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45 
 
 
417 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.56 
 
 
403 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.97 
 
 
410 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.58 
 
 
402 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.56 
 
 
403 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.05 
 
 
402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.63 
 
 
383 aa  342  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.08 
 
 
403 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.43 
 
 
399 aa  342  7e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.27 
 
 
396 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.47 
 
 
403 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.47 
 
 
403 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.15 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.43 
 
 
402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.96 
 
 
394 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.22 
 
 
394 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.61 
 
 
419 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  44.87 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0536  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.9 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.22 
 
 
412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.62 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.36 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.11 
 
 
404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.66 
 
 
405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.54 
 
 
402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.7 
 
 
401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.04 
 
 
403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.04 
 
 
407 aa  336  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.96 
 
 
412 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.43 
 
 
396 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.96 
 
 
412 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4034  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.04 
 
 
404 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0513  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.84 
 
 
410 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.62 
 
 
406 aa  334  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.99 
 
 
397 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.92 
 
 
405 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.92 
 
 
423 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.92 
 
 
423 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.92 
 
 
423 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.92 
 
 
423 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.92 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.92 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1851  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.97 
 
 
404 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.85 
 
 
391 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0500  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.71 
 
 
393 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.960396  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.78 
 
 
408 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.62 
 
 
408 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.75 
 
 
411 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3120  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.63 
 
 
428 aa  330  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4904  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.39 
 
 
401 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.247924  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1661  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.38 
 
 
394 aa  329  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.92 
 
 
396 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.96 
 
 
403 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0544  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.78 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.85 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.27 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3214  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.36 
 
 
413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.44 
 
 
408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.27 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10395  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.04 
 
 
406 aa  326  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173886  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.84 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.48 
 
 
397 aa  326  5e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.65 
 
 
406 aa  326  6e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1854  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.18 
 
 
397 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  decreased coverage  0.00243487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>